More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0091 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0091  dienelactone hydrolase  100 
 
 
234 aa  464  1e-130  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0171  dienelactone hydrolase  87.61 
 
 
234 aa  394  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.946862  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5090  dienelactone hydrolase  69.51 
 
 
215 aa  285  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.797701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1173  dienelactone hydrolase  42.11 
 
 
197 aa  140  2e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4503  putative carboxymethylenebutenolidase  34.16 
 
 
258 aa  82.4  6e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247167  normal  0.813173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  32.09 
 
 
263 aa  70.1  3e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  26.51 
 
 
251 aa  68.9  6e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  26.63 
 
 
263 aa  64.3  2e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  26.67 
 
 
254 aa  63.5  3e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  35.71 
 
 
270 aa  60.8  2e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  30.59 
 
 
321 aa  60.1  3e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  25.79 
 
 
263 aa  59.7  4e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  30.65 
 
 
246 aa  58.9  6e-08  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.35133e-08  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  28.45 
 
 
287 aa  58.9  6e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  29.17 
 
 
320 aa  58.9  7e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1922  phospholipase/Carboxylesterase  31.75 
 
 
231 aa  58.2  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1948  phospholipase/Carboxylesterase  31.75 
 
 
231 aa  58.2  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.25 
 
 
656 aa  58.2  1e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.95 
 
 
829 aa  56.6  3e-07  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  28.08 
 
 
261 aa  56.2  4e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  28.41 
 
 
249 aa  55.5  6e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  25.47 
 
 
292 aa  55.1  1e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  26.49 
 
 
262 aa  54.3  1e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  25.1 
 
 
300 aa  54.3  2e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  28.02 
 
 
245 aa  53.9  2e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1532  hypothetical protein  25.78 
 
 
225 aa  54.3  2e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.31 
 
 
623 aa  54.3  2e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0299  lipase, putative  22.84 
 
 
334 aa  53.9  2e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0304  putative lipase  22.84 
 
 
334 aa  54.3  2e-06  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.726693  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.39 
 
 
631 aa  54.3  2e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  26.27 
 
 
281 aa  53.5  3e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  27.72 
 
 
269 aa  53.1  3e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  28.12 
 
 
245 aa  53.5  3e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  27.46 
 
 
238 aa  53.1  4e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.5 
 
 
680 aa  52.8  5e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.6 
 
 
665 aa  52.4  6e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3247  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  25.67 
 
 
324 aa  52.4  6e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0807  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.63 
 
 
827 aa  52.4  6e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.93911e-05  hitchhiker  0.00280594 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  28.46 
 
 
291 aa  52.4  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  28.46 
 
 
291 aa  52.4  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  28.46 
 
 
291 aa  52.4  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  28.46 
 
 
291 aa  52.4  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  26.74 
 
 
278 aa  52  8e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.11 
 
 
823 aa  52  8e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.57692e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2300  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  19.92 
 
 
327 aa  52  8e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000887585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  40 
 
 
588 aa  52  8e-06  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  28.7 
 
 
290 aa  52  9e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  28.7 
 
 
290 aa  52  9e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  28.7 
 
 
290 aa  51.6  9e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0642  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.75 
 
 
826 aa  51.6  9e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  27.16 
 
 
691 aa  51.6  9e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.00124e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.07 
 
 
827 aa  51.6  9e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  28.12 
 
 
245 aa  51.6  1e-05  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  28.19 
 
 
356 aa  51.2  1e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  33.82 
 
 
321 aa  51.2  1e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  28.7 
 
 
270 aa  51.2  1e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.35 
 
 
621 aa  51.6  1e-05  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  28.19 
 
 
243 aa  51.6  1e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  24.38 
 
 
615 aa  51.2  1e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  28.95 
 
 
243 aa  51.6  1e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  30.17 
 
 
291 aa  51.6  1e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  27.66 
 
 
263 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0608  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.75 
 
 
826 aa  50.8  2e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  22.95 
 
 
257 aa  50.4  2e-05  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  35.56 
 
 
237 aa  50.4  2e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3422  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.75 
 
 
826 aa  50.8  2e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.286167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.75 
 
 
826 aa  50.4  2e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770988 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3173  esterase YpfH  30.3 
 
 
205 aa  51.2  2e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  38.36 
 
 
303 aa  50.4  2e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.07 
 
 
831 aa  50.1  3e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  27.83 
 
 
271 aa  50.1  3e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  29.81 
 
 
287 aa  50.1  3e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 
271 aa  50.1  3e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  26.94 
 
 
238 aa  50.4  3e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  27.83 
 
 
271 aa  50.1  3e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  27.83 
 
 
271 aa  50.1  3e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3014  dipeptidyl peptidase IV, putative  27.63 
 
 
824 aa  50.1  3e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003026  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  27.83 
 
 
271 aa  50.1  3e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  44.12 
 
 
716 aa  50.1  3e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.996189  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1790  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  40.22 
 
 
537 aa  50.1  3e-05  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0734041  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  27.83 
 
 
269 aa  50.1  3e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  27.83 
 
 
267 aa  50.1  3e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0499  esterase/lipase-like protein  22.22 
 
 
286 aa  49.7  4e-05  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3700  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.75 
 
 
826 aa  49.7  4e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.63184e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.07 
 
 
596 aa  49.7  4e-05  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  25 
 
 
681 aa  49.7  4e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  36.52 
 
 
467 aa  49.7  4e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.53 
 
 
612 aa  49.3  4e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  27.83 
 
 
269 aa  49.7  4e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0293  dienelactone hydrolase  32.18 
 
 
245 aa  49.7  4e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  27.04 
 
 
270 aa  49.7  4e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  46.94 
 
 
575 aa  49.7  4e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  23.36 
 
 
596 aa  49.3  5e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0056  putative esterase  22.9 
 
 
317 aa  49.3  5e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.728822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  26.92 
 
 
275 aa  49.3  5e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3195  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.19 
 
 
828 aa  48.9  6e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  33.91 
 
 
220 aa  48.9  6e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.64 
 
 
675 aa  48.9  6e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.94 
 
 
689 aa  48.9  6e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.0034e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2728  phospholipase/carboxylesterase  33.91 
 
 
220 aa  48.9  7e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>