More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1915 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
382 aa  787    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  74.87 
 
 
382 aa  618  1e-176  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  73.42 
 
 
382 aa  610  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  70.03 
 
 
382 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  68.17 
 
 
384 aa  567  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  61.58 
 
 
385 aa  508  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  60.52 
 
 
385 aa  502  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  57.7 
 
 
388 aa  458  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  56.96 
 
 
390 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  53.83 
 
 
401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.35 
 
 
392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.76 
 
 
389 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  55.32 
 
 
384 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.23 
 
 
388 aa  437  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.81 
 
 
391 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.63 
 
 
388 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  57.63 
 
 
392 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  52.11 
 
 
390 aa  428  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.69 
 
 
387 aa  428  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.37 
 
 
388 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.32 
 
 
388 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  52.65 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  48.42 
 
 
389 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.18 
 
 
390 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  47.64 
 
 
391 aa  395  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  48.54 
 
 
403 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  47.78 
 
 
392 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  46.23 
 
 
392 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  46.97 
 
 
402 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  46.42 
 
 
400 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  45.77 
 
 
386 aa  378  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  45.89 
 
 
394 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  45.62 
 
 
394 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  49.61 
 
 
387 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  45.29 
 
 
409 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  44.83 
 
 
391 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  45.57 
 
 
389 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  44.24 
 
 
390 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  43.42 
 
 
395 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  44.24 
 
 
393 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  44.24 
 
 
397 aa  363  3e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  44.24 
 
 
394 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  45.69 
 
 
390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  44.21 
 
 
393 aa  362  8e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  43.19 
 
 
397 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  42.93 
 
 
397 aa  359  5e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  42.15 
 
 
391 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  44.09 
 
 
388 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  43.72 
 
 
394 aa  355  5e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  45.03 
 
 
400 aa  354  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  44.24 
 
 
399 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  44.62 
 
 
394 aa  351  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  44.5 
 
 
393 aa  348  8e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  44.5 
 
 
393 aa  348  8e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  44.24 
 
 
405 aa  348  8e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  44.95 
 
 
407 aa  348  9e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  42.26 
 
 
396 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  42.15 
 
 
403 aa  348  1e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  43.46 
 
 
425 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  42.11 
 
 
421 aa  346  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  45.57 
 
 
395 aa  345  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  43.42 
 
 
413 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  42.78 
 
 
388 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  43.19 
 
 
413 aa  342  9e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  41.71 
 
 
407 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  44.13 
 
 
396 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  41.88 
 
 
411 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  43.46 
 
 
418 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  42.41 
 
 
403 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  42.41 
 
 
411 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  42.67 
 
 
411 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  41.88 
 
 
402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  42.11 
 
 
402 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  42.67 
 
 
413 aa  339  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  41.84 
 
 
407 aa  339  5.9999999999999996e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  42.15 
 
 
402 aa  338  7e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  42.41 
 
 
411 aa  338  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  42.67 
 
 
407 aa  338  8e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  42.41 
 
 
411 aa  338  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  42.41 
 
 
411 aa  338  8e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1394  aminotransferase class I and II  41.88 
 
 
408 aa  338  8e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  41.75 
 
 
400 aa  337  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  42.15 
 
 
411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  41.88 
 
 
412 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  42.15 
 
 
402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  41.84 
 
 
402 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  42.93 
 
 
412 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  42.93 
 
 
412 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  42.93 
 
 
412 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  42.93 
 
 
412 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  42.93 
 
 
412 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  41.88 
 
 
411 aa  335  7e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  41.58 
 
 
402 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  42.41 
 
 
412 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  42.41 
 
 
412 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  42.41 
 
 
412 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  42.41 
 
 
412 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  42.41 
 
 
412 aa  334  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  42.41 
 
 
412 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  41.62 
 
 
412 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.890867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>