164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3110 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  97.51 
 
 
361 aa  637  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  100 
 
 
361 aa  697  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  87.14 
 
 
362 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  63.29 
 
 
367 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  65.83 
 
 
356 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  62.22 
 
 
367 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  50.14 
 
 
376 aa  321  1e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  50.27 
 
 
375 aa  320  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  55.62 
 
 
368 aa  314  2e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  50 
 
 
390 aa  313  3e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  48.9 
 
 
376 aa  306  4e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  48.49 
 
 
379 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  47.24 
 
 
375 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  49.74 
 
 
386 aa  293  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  46.72 
 
 
375 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  51.53 
 
 
356 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  46.48 
 
 
366 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  46.91 
 
 
366 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  49.43 
 
 
351 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  44.99 
 
 
367 aa  262  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  47.11 
 
 
369 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  46.09 
 
 
358 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  52.5 
 
 
353 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  50.14 
 
 
355 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  48.47 
 
 
356 aa  248  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  43.92 
 
 
363 aa  245  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  49.15 
 
 
371 aa  244  2e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  48.15 
 
 
363 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  44.57 
 
 
377 aa  239  6e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  52.78 
 
 
353 aa  236  5e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  47.26 
 
 
357 aa  236  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  42.38 
 
 
365 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  35.54 
 
 
335 aa  230  3e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  42.11 
 
 
365 aa  229  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  47.85 
 
 
351 aa  229  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  38.51 
 
 
366 aa  228  9e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  48.57 
 
 
364 aa  226  5e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  54.11 
 
 
351 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  34.3 
 
 
349 aa  224  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  35.65 
 
 
335 aa  220  3e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  35.88 
 
 
449 aa  216  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  45.2 
 
 
324 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  39.19 
 
 
366 aa  209  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  46.4 
 
 
339 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  41.09 
 
 
402 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  39.89 
 
 
461 aa  201  1e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  30.22 
 
 
515 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  34.42 
 
 
323 aa  181  2e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  30.51 
 
 
504 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  36.03 
 
 
386 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  32.76 
 
 
349 aa  128  2e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  36.14 
 
 
404 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  35.53 
 
 
384 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  31.68 
 
 
370 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  32.12 
 
 
388 aa  122  1e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  32.12 
 
 
417 aa  122  1e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  31.47 
 
 
394 aa  119  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4224  hypothetical protein  37.17 
 
 
376 aa  119  1e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.203293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0497  hypothetical protein  37.5 
 
 
366 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0818401 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  29.97 
 
 
370 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0510  protein of unknown function DUF185  37.14 
 
 
362 aa  117  4e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  36.29 
 
 
391 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  32.45 
 
 
397 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  29.86 
 
 
370 aa  115  1e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  33.9 
 
 
360 aa  114  2e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1451  hypothetical protein  33.33 
 
 
410 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0695553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  34.23 
 
 
397 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  36.47 
 
 
398 aa  112  1e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  33.62 
 
 
396 aa  111  2e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0812  hypothetical protein  31.41 
 
 
375 aa  111  2e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  33.78 
 
 
396 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  34.55 
 
 
358 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  30.03 
 
 
393 aa  110  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  24.87 
 
 
384 aa  109  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  34.21 
 
 
396 aa  109  9e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  35.28 
 
 
394 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  31.47 
 
 
392 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  33.82 
 
 
386 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1711  protein of unknown function DUF185  27.72 
 
 
395 aa  105  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.676361  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1466  hypothetical protein  35.77 
 
 
369 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  32.23 
 
 
393 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1251  hypothetical protein  34.02 
 
 
337 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  32.72 
 
 
396 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  34.41 
 
 
393 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0294  hypothetical protein  33.6 
 
 
410 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0048  protein of unknown function DUF185  33.71 
 
 
397 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.244588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  34.16 
 
 
387 aa  102  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  1.18713e-06 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  33.24 
 
 
400 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2702  hypothetical protein  33.8 
 
 
384 aa  102  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1996  hypothetical protein  28.76 
 
 
395 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3384  hypothetical protein  34.38 
 
 
410 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  7.10511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  28.35 
 
 
397 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0523  hypothetical protein  34.38 
 
 
410 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0343  hypothetical protein  34.38 
 
 
396 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2248  hypothetical protein  34.38 
 
 
396 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  27.62 
 
 
400 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2036  hypothetical protein  34.38 
 
 
396 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3057  hypothetical protein  34.38 
 
 
396 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.797312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0330  hypothetical protein  34.38 
 
 
396 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0801  hypothetical protein  31.45 
 
 
394 aa  99.4  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>