188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2373 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  100 
 
 
287 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  97.91 
 
 
287 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  94.01 
 
 
292 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  68.29 
 
 
293 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  65.98 
 
 
299 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  68.75 
 
 
289 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1862  acyl-CoA thioesterase II  59.72 
 
 
303 aa  340  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.93699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3238  acyl-CoA thioesterase II  57.34 
 
 
288 aa  330  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  58.51 
 
 
294 aa  328  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  56.25 
 
 
300 aa  319  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  57.45 
 
 
300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0370  acyl-CoA thioesterase II  57.14 
 
 
291 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  55.09 
 
 
294 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  56.94 
 
 
296 aa  315  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  56.43 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0272  acyl-CoA thioesterase II  56.07 
 
 
291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  54.23 
 
 
294 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0452  acyl-CoA thioesterase II  56.07 
 
 
293 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  0.290685 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  56.32 
 
 
311 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  55.44 
 
 
291 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  56.32 
 
 
300 aa  308  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  56.07 
 
 
286 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  53.9 
 
 
294 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  57.39 
 
 
314 aa  289  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  51.05 
 
 
289 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  50 
 
 
289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  50.7 
 
 
289 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  50 
 
 
285 aa  281  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4916  palmitoyl-CoA hydrolase  49.83 
 
 
289 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000279836  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2137  acyl-CoA thioesterase II  53.5 
 
 
288 aa  277  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  50.52 
 
 
286 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  55.52 
 
 
310 aa  277  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  49.82 
 
 
289 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  51.09 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  49.82 
 
 
289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  52.19 
 
 
289 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  54.26 
 
 
301 aa  271  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  50.72 
 
 
288 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  50.72 
 
 
288 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  50.72 
 
 
288 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0997  palmitoyl-CoA hydrolase  54.26 
 
 
295 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  51.82 
 
 
289 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2818  acyl-CoA thioesterase II  50.36 
 
 
288 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2722  acyl-CoA thioesterase II  48.9 
 
 
286 aa  269  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.700774  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  51.46 
 
 
289 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  51.11 
 
 
288 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  51.11 
 
 
288 aa  269  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  51.46 
 
 
289 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3210  acyl-CoA thioesterase II  49.08 
 
 
288 aa  268  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00091585  unclonable  0.0000000140962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1728  acyl-CoA thioesterase II  50.74 
 
 
288 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1670  acyl-CoA thioesterase II  49.27 
 
 
287 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000026944  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  45.61 
 
 
285 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  50.74 
 
 
288 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05531  acyl-CoA thioesterase II  50.9 
 
 
301 aa  265  8e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00816799  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  45.8 
 
 
289 aa  265  8e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  51.21 
 
 
290 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2732  palmitoyl-CoA hydrolase  49.27 
 
 
281 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0611615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1466  palmitoyl-CoA hydrolase  49.26 
 
 
288 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203719  hitchhiker  0.0000792581 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  52.69 
 
 
300 aa  263  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  48.89 
 
 
287 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  54.09 
 
 
277 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  52.11 
 
 
314 aa  261  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4891  palmitoyl-CoA hydrolase  48.94 
 
 
286 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1368  palmitoyl-CoA hydrolase  50.56 
 
 
289 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  47.78 
 
 
286 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1912  acyl-CoA thioesterase II  49.63 
 
 
288 aa  259  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0359  Choloyl-CoA hydrolase  51.42 
 
 
292 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  47.78 
 
 
286 aa  258  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  47.78 
 
 
286 aa  258  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0838  acyl-CoA thioesterase  49.12 
 
 
268 aa  257  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  47.45 
 
 
287 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1113  acyl-CoA thioesterase II  50.88 
 
 
306 aa  253  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.247123  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1062  acyl-CoA thioesterase II  47.94 
 
 
287 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  51.57 
 
 
283 aa  252  6e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  48.29 
 
 
287 aa  250  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2238  Acyl-CoA thioesterase  50.56 
 
 
284 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.58681  hitchhiker  0.0000000000102544 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  51.79 
 
 
299 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3249  acyl-CoA thioesterase II  47.57 
 
 
287 aa  248  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  45.63 
 
 
286 aa  248  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  48.47 
 
 
287 aa  247  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004014  acyl-CoA thioesterase II  44.74 
 
 
286 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01450  acyl-CoA thioesterase II  45.04 
 
 
286 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  48.61 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1968  acyl-CoA thioesterase II  44.78 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517331  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  48.4 
 
 
291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  45.42 
 
 
286 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  45.42 
 
 
286 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  45.42 
 
 
286 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  45.42 
 
 
286 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  45.42 
 
 
286 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  45.42 
 
 
286 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  45.42 
 
 
286 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  45.42 
 
 
286 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  45.96 
 
 
286 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  45.42 
 
 
286 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0337  palmitoyl-CoA hydrolase  47.99 
 
 
310 aa  239  4e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00101802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2666  palmitoyl-CoA hydrolase  47.67 
 
 
305 aa  238  8e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  45.42 
 
 
286 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0306  palmitoyl-CoA hydrolase  47.99 
 
 
283 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000146303  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  45.42 
 
 
286 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>