More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0288 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  73.93 
 
 		 211 aa  323  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.86 
 
 		 207 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  54.4 
 
 		 129 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.37 
 
 		 131 aa  142  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.76 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  52.46 
 
 		 129 aa  142  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  50.81 
 
 		 144 aa  142  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.39 
 
 		 150 aa  141  9e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.82 
 
 		 124 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  55.37 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.61 
 
 		 145 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  51.97 
 
 		 149 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  50 
 
 		 144 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50 
 
 		 142 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 133 aa  138  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 		 133 aa  138  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  52.07 
 
 		 124 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  51.64 
 
 		 123 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  54.47 
 
 		 143 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  52.34 
 
 		 128 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  50 
 
 		 125 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.21 
 
 		 139 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.5 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  51.56 
 
 		 128 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.29 
 
 		 153 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.8 
 
 		 132 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  51.56 
 
 		 128 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  51.56 
 
 		 128 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  50.78 
 
 		 128 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  51.56 
 
 		 128 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  51.24 
 
 		 139 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  49.6 
 
 		 128 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  47.76 
 
 		 138 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.76 
 
 		 138 aa  132  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  50.78 
 
 		 128 aa  131  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  51.56 
 
 		 128 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  50 
 
 		 129 aa  131  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.67 
 
 		 277 aa  131  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 		 284 aa  131  6.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  48.39 
 
 		 143 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.53 
 
 		 133 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.82 
 
 		 127 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  48.03 
 
 		 133 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  50 
 
 		 128 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.29 
 
 		 132 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.67 
 
 		 146 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.8 
 
 		 133 aa  128  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  48.33 
 
 		 122 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.24 
 
 		 137 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  45.8 
 
 		 132 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  47.37 
 
 		 133 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  46.88 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  47.37 
 
 		 133 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  47.37 
 
 		 133 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  46.67 
 
 		 142 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  49.22 
 
 		 128 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  49.22 
 
 		 128 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.1 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.42 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  50.42 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.15 
 
 		 137 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0628  scaffold protein  45.26 
 
 		 153 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0619  scaffold protein  45.26 
 
 		 153 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.23 
 
 		 153 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0718  scaffold protein  47.2 
 
 		 125 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.62 
 
 		 135 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.41 
 
 		 134 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.03 
 
 		 128 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0593  scaffold protein  44.53 
 
 		 153 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  46.83 
 
 		 133 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  45.04 
 
 		 137 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  48 
 
 		 128 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  45.26 
 
 		 138 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01056  scaffold protein  47.2 
 
 		 127 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  48 
 
 		 128 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  45.11 
 
 		 135 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0638  scaffold protein  45.26 
 
 		 153 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.537627  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.62 
 
 		 135 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004359  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU  47.2 
 
 		 127 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.901074  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0278  scaffold protein  47.2 
 
 		 127 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00334373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  43.36 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  50.82 
 
 		 125 aa  122  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 		 286 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.46 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  44.44 
 
 		 135 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  44.44 
 
 		 135 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1951  scaffold protein  47.62 
 
 		 127 aa  121  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000468917  normal  0.344726 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  46.4 
 
 		 128 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  46.4 
 
 		 128 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  46.4 
 
 		 128 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  47.2 
 
 		 128 aa  121  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  46.4 
 
 		 128 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  46.4 
 
 		 128 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  47.5 
 
 		 312 aa  121  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  44.44 
 
 		 135 aa  121  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5952  scaffold protein  46.46 
 
 		 135 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2142  scaffold protein  46.46 
 
 		 135 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2125  scaffold protein  46.46 
 
 		 135 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2216  scaffold protein  47.2 
 
 		 135 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>