More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1822 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1822  iron-sulfur flavoprotein  100 
 
 
193 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000643052  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0163  NADPH-dependent FMN reductase  57.14 
 
 
195 aa  230  8.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  56.83 
 
 
187 aa  227  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  50.53 
 
 
193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  50 
 
 
193 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0718  NADPH-dependent FMN reductase  48.95 
 
 
193 aa  175  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0078  NADPH-dependent FMN reductase  48.7 
 
 
193 aa  174  8e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.45768  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0010  NADPH-dependent FMN reductase  46.11 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0486  NADPH-dependent FMN reductase  41.45 
 
 
197 aa  141  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0421  NADPH-dependent FMN reductase  40.21 
 
 
197 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1505  NADPH-dependent FMN reductase  38.86 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0414  NADPH-dependent FMN reductase  38.86 
 
 
197 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0321  NADPH-dependent FMN reductase  37.82 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.378386  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0755  NADPH-dependent FMN reductase  35.9 
 
 
213 aa  124  7e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.263848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0870  NADPH-dependent FMN reductase  38.02 
 
 
195 aa  122  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000162046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0549  NADPH-dependent FMN reductase  35.64 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2465  NADPH-dependent FMN reductase  38.22 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2377  NADPH-dependent FMN reductase  33.5 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000848109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0252  iron-sulfur flavoprotein  37 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3039  NADPH-dependent FMN reductase  35.42 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.301206 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1510  NADPH-dependent FMN reductase  36.32 
 
 
202 aa  109  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2010  NADPH-dependent FMN reductase  40.54 
 
 
207 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000015054  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2381  NADPH-dependent FMN reductase  34.01 
 
 
195 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.19679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1043  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
192 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.603654  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2302  iron-sulfur flavoprotein  36.6 
 
 
192 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.52552  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1385  iron-sulfur flavoprotein  36.84 
 
 
191 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0316  NADPH-dependent FMN reductase  38.51 
 
 
212 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1851  NADPH-dependent FMN reductase  33.5 
 
 
204 aa  102  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0492811  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1623  hypothetical protein  34.74 
 
 
194 aa  101  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0489  NADPH-dependent FMN reductase  36.93 
 
 
206 aa  99.8  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1371  NADPH-dependent FMN reductase  30.35 
 
 
190 aa  96.3  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1182  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
190 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000238882  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0650  NADPH-dependent FMN reductase  35.8 
 
 
190 aa  95.9  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1104  putative NADPH-dependent FMN reductase  38.04 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.334062  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1441  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
192 aa  95.1  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.517367  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1057  NADPH-dependent FMN reductase  34.21 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.840292  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1637  NADPH-dependent FMN reductase  32.29 
 
 
191 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0800599  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2158  NADPH-dependent FMN reductase  35.11 
 
 
205 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1543  NADPH-dependent FMN reductase  32.29 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0882991  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0452  NADPH-dependent FMN reductase  47.47 
 
 
211 aa  92  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0109  NADPH-dependent FMN reductase  31.44 
 
 
191 aa  91.7  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0158  NADPH-dependent FMN reductase  39.47 
 
 
206 aa  92  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  34.74 
 
 
190 aa  91.7  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0991  NADPH-dependent FMN reductase  32.81 
 
 
199 aa  91.7  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.451509  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1058  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
192 aa  91.3  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0225  NADPH-dependent FMN reductase  32.98 
 
 
189 aa  90.9  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.545185  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1072  NADPH-dependent FMN reductase  37.68 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2732  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1152  NADPH-dependent FMN reductase  30.85 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000059068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0621  NADPH-dependent FMN reductase  32.84 
 
 
201 aa  89  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.295503  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1142  NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 
191 aa  89  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.776292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0076  NADPH-dependent FMN reductase  37.72 
 
 
202 aa  88.6  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.399945  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1132  hypothetical protein  44.44 
 
 
212 aa  88.6  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1487  NADPH-dependent FMN reductase  32.28 
 
 
198 aa  88.2  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.535714  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
223 aa  88.2  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0455  NADPH-dependent FMN reductase  34.36 
 
 
204 aa  88.2  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0622155  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0277  NADPH-dependent FMN reductase  31.77 
 
 
199 aa  88.2  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2535  NADPH-dependent FMN reductase  36.26 
 
 
191 aa  87.8  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.437841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1378  iron-sulfur flavoprotein  29.2 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  38.1 
 
 
184 aa  85.9  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3707  NADPH-dependent FMN reductase  31.76 
 
 
208 aa  84.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0930977 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1751  NADPH-dependent FMN reductase  28.57 
 
 
208 aa  84.7  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2261  NADPH-dependent FMN reductase  42 
 
 
222 aa  84.7  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  0.127615 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  36.28 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1264  NADPH-dependent FMN reductase  29.84 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246056  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2733  NADPH-dependent FMN reductase  34.4 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1713  NADPH-dependent FMN reductase  34.95 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2925  NADPH-dependent FMN reductase  31.75 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000194359  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1029  iron-sulfur flavoprotein  32.11 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.343926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1770  NADPH-dependent FMN reductase  34.05 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000383709  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1638  NADPH-dependent FMN reductase  37.01 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0739804  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0293  NADPH-dependent FMN reductase  29.08 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000996855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1241  NADPH-dependent FMN reductase  43.56 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0094  NADPH-dependent FMN reductase  32.56 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.57 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0722  NADPH-dependent FMN reductase  30.39 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.658969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0179  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.31 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1149  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.285301  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  36.28 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1626  NADPH-dependent FMN reductase  35.1 
 
 
220 aa  82  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.65491  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2817  NADPH-dependent FMN reductase  26.94 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  30 
 
 
185 aa  82  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1785  NADPH-dependent FMN reductase  37.37 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000137448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0797  hypothetical protein  30.94 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000338584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1561  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 
206 aa  81.3  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1170  FMN reductase, NADPH-dependent  33.13 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0077  NADPH-dependent FMN reductase  24.51 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1507  NADPH-dependent FMN reductase  30.41 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.569037  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  35.4 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2482  NADPH-dependent FMN reductase  38 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  32.67 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2419  NADPH-dependent FMN reductase  28.72 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.873931  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  29.19 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0309  NADPH-dependent FMN reductase  34.48 
 
 
212 aa  79  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.677573  normal  0.46628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2997  NADPH-dependent FMN reductase  29.67 
 
 
184 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0315889  normal  0.693807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0071  NADPH-dependent FMN reductase  42.86 
 
 
159 aa  79  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109479  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0408  NADPH-dependent FMN reductase  37.86 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0017  NADPH-dependent FMN reductase  28.12 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11340  multimeric flavodoxin WrbA  30.46 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  29.69 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>