30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1571 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  100 
 
 		 414 aa  852    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  52.1 
 
 		 390 aa  421  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  43.03 
 
 		 395 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  41.98 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  41.39 
 
 		 378 aa  276  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  39.22 
 
 		 374 aa  262  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  36.43 
 
 		 391 aa  249  9e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  38.63 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  36.8 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  37.83 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  37.68 
 
 		 388 aa  236  6e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  35.99 
 
 		 386 aa  236  7e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  35.61 
 
 		 392 aa  233  6e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  35.34 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  31.18 
 
 		 389 aa  172  9e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  29.23 
 
 		 348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  33.21 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  41.04 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  25.91 
 
 		 373 aa  120  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  38.15 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  40.66 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  33.33 
 
 		 330 aa  95.5  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  30.99 
 
 		 357 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  27.45 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  31.71 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  28.43 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  24.53 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  24.33 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03033  DNA primase subunit Pri1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09020)  24.13 
 
 		 521 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.344659 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  22.22 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>