56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0055 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  790    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  48.47 
 
 		 280 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  46.67 
 
 		 271 aa  207  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  45.56 
 
 		 291 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  29.38 
 
 		 242 aa  91.3  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2968  Abortive infection protein  30.77 
 
 		 244 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.337339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0699  abortive infection protein  29.9 
 
 		 246 aa  87  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0773  CAAX amino terminal protease family protein  29.9 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5184  hypothetical protein  35.96 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0151548 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  38.2 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  29.66 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  32.17 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6387  hypothetical protein  28.17 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5653  abortive infection protein  34.78 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.122774 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  40.2 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  34.44 
 
 		 278 aa  50.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  38.82 
 
 		 272 aa  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  31.65 
 
 		 241 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  37.66 
 
 		 261 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  23.57 
 
 		 319 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  34.55 
 
 		 775 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  32.26 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1384  conserved hypothetical protein, putative metal-dependent membrane protease  36.96 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2685  abortive infection protein  37.18 
 
 		 252 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0320282  normal  0.973505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  38.16 
 
 		 480 aa  47.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  29.41 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02490  Abortive infection protein  37.04 
 
 		 208 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  35.35 
 
 		 251 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  30.47 
 
 		 289 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2854  CAAX amino terminal protease family protein  36.17 
 
 		 272 aa  46.6  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1414  CAAX amino terminal protease family protein  36.17 
 
 		 272 aa  46.6  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  27.74 
 
 		 337 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2942  abortive infection protein  36.17 
 
 		 272 aa  46.6  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5866  hypothetical protein  36.59 
 
 		 272 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  28.47 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  28.47 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  28.47 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  28.85 
 
 		 276 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  36.14 
 
 		 193 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67780  hypothetical protein  36.59 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  28.47 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  31.58 
 
 		 280 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  27.74 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  32.22 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  36.05 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  24.83 
 
 		 346 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  34.83 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  32.26 
 
 		 297 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  27.01 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  27.97 
 
 		 251 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2468  Abortive infection protein  29.81 
 
 		 317 aa  43.5  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.846386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0915  Abortive infection protein  25.83 
 
 		 284 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.17238  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03881  abortive infection protein  36.21 
 
 		 288 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>