33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0773 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0773  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 		 246 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_679  CAAX amino terminal protease  84.71 
 
 		 242 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0699  abortive infection protein  82.93 
 
 		 246 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2968  Abortive infection protein  37.5 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.337339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  29.9 
 
 		 396 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  32.76 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  29.67 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1146  CAAX amino terminal protease family protein  28.37 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3804  CAAX amino terminal protease family protein  29.11 
 
 		 187 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000276045  hitchhiker  1.95996e-16 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2468  Abortive infection protein  34.95 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.846386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1541  CAAX amino terminal protease family protein  28.48 
 
 		 187 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1506  CAAX amino terminal protease family protein  28.48 
 
 		 187 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000177137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1367  CAAX amino terminal protease family protein  27.85 
 
 		 188 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000155141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1368  CAAX amino terminal protease family protein  27.85 
 
 		 187 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.63471e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2712  Abortive infection protein  30.58 
 
 		 372 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1395  CAAX amino terminal protease family protein  28.48 
 
 		 187 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000488789  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1580  CAAX amino terminal protease family protein  27.85 
 
 		 187 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.2764399999999996e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1647  CAAX amino terminal protease family protein  27.85 
 
 		 187 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000557055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1611  CAAX amino terminal protease family protein  27.85 
 
 		 170 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000156991  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2598  abortive infection protein  36.05 
 
 		 198 aa  49.3  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000681964  hitchhiker  0.000046555 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1846  Abortive infection protein  31.82 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1408  abortive infection protein  26.58 
 
 		 187 aa  45.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000101679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1209  abortive infection protein  31.43 
 
 		 188 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  34.83 
 
 		 276 aa  45.4  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  29.76 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  30.85 
 
 		 374 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0793  abortive infection protein  33.33 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0181  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 140 aa  43.5  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000000181447 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0721  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31340  predicted metal-dependent membrane protease  31.03 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249582  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  30.56 
 
 		 272 aa  43.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0555  abortive infection protein  42.62 
 
 		 330 aa  42.7  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0657332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  36.36 
 
 		 269 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>