141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf033 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf033  phosphopentomutase  100 
 
 
396 aa  817    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  47.5 
 
 
396 aa  353  4e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  47.25 
 
 
396 aa  352  5e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  45.84 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  44.84 
 
 
394 aa  333  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  44.58 
 
 
394 aa  331  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  44.58 
 
 
394 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  44.58 
 
 
394 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  44.58 
 
 
394 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  44.58 
 
 
394 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  44.58 
 
 
394 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  44.58 
 
 
394 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  44.58 
 
 
394 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  44.33 
 
 
394 aa  330  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  42.49 
 
 
393 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  41.48 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0112  phosphopentomutase  42.27 
 
 
397 aa  300  4e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000070678  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1001  phosphopentomutase  39.42 
 
 
411 aa  299  6e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0125  phosphopentomutase  40.31 
 
 
392 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0130  phosphopentomutase  40.31 
 
 
392 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1077  phosphopentomutase  40.79 
 
 
403 aa  296  5e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1743  phosphopentomutase  39.03 
 
 
396 aa  292  7e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  43.05 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1182  phosphopentomutase  38.82 
 
 
403 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2069  phosphopentomutase  38.82 
 
 
403 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0253086  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0037  phosphopentomutase  39.04 
 
 
391 aa  278  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000700156  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3719  phosphopentomutase  38.62 
 
 
390 aa  277  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  39.29 
 
 
389 aa  275  8e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  41.23 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  38.5 
 
 
420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  40 
 
 
397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  37.53 
 
 
392 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1472  phosphopentomutase  38.62 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215441  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  41.53 
 
 
397 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  39.06 
 
 
390 aa  265  8e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  38.23 
 
 
390 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0610  phosphopentomutase  40.39 
 
 
392 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  36.55 
 
 
392 aa  263  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2320  phosphopentomutase  37.44 
 
 
392 aa  263  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000329879  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  37.91 
 
 
396 aa  262  8e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  37.65 
 
 
407 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  37.65 
 
 
407 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  37.65 
 
 
407 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  38.28 
 
 
390 aa  259  7e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2314  phosphopentomutase  39.39 
 
 
385 aa  258  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.932975  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  36.04 
 
 
388 aa  257  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  36.73 
 
 
388 aa  256  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  36.61 
 
 
407 aa  255  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  36.61 
 
 
407 aa  255  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  36.61 
 
 
407 aa  255  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  36.61 
 
 
407 aa  255  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  36.61 
 
 
407 aa  255  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  36.61 
 
 
407 aa  255  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  36.61 
 
 
407 aa  255  9e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  36.61 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  36.61 
 
 
407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  40.4 
 
 
396 aa  252  9.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  36.22 
 
 
391 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  36.36 
 
 
407 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  36.14 
 
 
404 aa  249  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06950  phosphopentomutase  40.06 
 
 
349 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.56293  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  39.49 
 
 
388 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  36.67 
 
 
407 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  35.54 
 
 
404 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  36.1 
 
 
407 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  36.1 
 
 
407 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  36.1 
 
 
407 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  36.1 
 
 
407 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  36.19 
 
 
407 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  35.31 
 
 
405 aa  247  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  36.1 
 
 
407 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1281  phosphopentomutase  36.25 
 
 
397 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.477667  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0956  phosphopentomutase  39.2 
 
 
388 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  38.92 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  34.96 
 
 
407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  34.98 
 
 
404 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  34.98 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  34.98 
 
 
404 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  34.98 
 
 
404 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  34.74 
 
 
405 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  35.18 
 
 
406 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1749  phosphopentomutase  34.61 
 
 
390 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0951  phosphopentomutase  38.64 
 
 
389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  38.9 
 
 
397 aa  239  4e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3091  phosphopentomutase  36.39 
 
 
384 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0618419  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0586  phosphopentomutase  37.37 
 
 
392 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.036632  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  35.31 
 
 
407 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  34.99 
 
 
405 aa  237  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  33.08 
 
 
407 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  36.1 
 
 
407 aa  237  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2863  phosphopentomutase  33.89 
 
 
415 aa  237  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0829  phosphopentomutase  37.47 
 
 
399 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.654335  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2985  phosphopentomutase  36.59 
 
 
402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  33.33 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  35.06 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2221  phosphopentomutase  38.16 
 
 
394 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526738  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1039  phosphopentomutase  36.3 
 
 
404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536446  hitchhiker  0.0000000672539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3046  phosphopentomutase  35.68 
 
 
405 aa  233  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.308084  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1043  phosphopentomutase  36.3 
 
 
404 aa  233  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000600335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  33.58 
 
 
406 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>