More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03503 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03503  Secreted protein with uncharacterized domain  100 
 
 
660 aa  1357    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.15 
 
 
554 aa  111  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2017  hypothetical protein  28.43 
 
 
287 aa  101  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000795883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  30.97 
 
 
413 aa  99  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  30.08 
 
 
267 aa  97.4  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  29.15 
 
 
489 aa  97.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  27.99 
 
 
263 aa  96.3  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  25.18 
 
 
613 aa  92.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  29.69 
 
 
616 aa  91.3  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  29.48 
 
 
587 aa  91.3  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 
623 aa  90.9  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  30.25 
 
 
636 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0078  serine/threonine protein kinase  25.99 
 
 
872 aa  88.6  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  32.67 
 
 
336 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  32.23 
 
 
358 aa  87  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  28.57 
 
 
293 aa  87  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  27.39 
 
 
325 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  28.62 
 
 
298 aa  86.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  28.62 
 
 
338 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  31.96 
 
 
226 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  30.18 
 
 
882 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  27.57 
 
 
586 aa  85.5  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  29.48 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  27.86 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  27.41 
 
 
654 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2106  hypothetical protein  28.69 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  33.79 
 
 
224 aa  84  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2802  hypothetical protein  29.9 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3831  protein of unknown function DUF323  33.49 
 
 
223 aa  84  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  27.1 
 
 
398 aa  83.2  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  31.25 
 
 
225 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  27.03 
 
 
657 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  30.92 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  27.48 
 
 
556 aa  81.3  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  27.21 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  32.18 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2118  hypothetical protein  29.29 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.134861  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2903  protein of unknown function DUF323  30.83 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3574  protein of unknown function DUF323  27.96 
 
 
768 aa  80.5  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  30.05 
 
 
225 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7515  hypothetical protein  30.36 
 
 
245 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.888834 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  29.44 
 
 
226 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  27.3 
 
 
637 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  24.83 
 
 
820 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  30.46 
 
 
226 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  30.84 
 
 
351 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2145  hypothetical protein  33.49 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 
625 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  32.85 
 
 
292 aa  79  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  29.43 
 
 
617 aa  78.2  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  31.73 
 
 
929 aa  78.2  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  30.2 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 
618 aa  77.8  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 
509 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  29.56 
 
 
620 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  26.58 
 
 
603 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  26.13 
 
 
826 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  28.06 
 
 
523 aa  77  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 
637 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5254  hypothetical protein  32.73 
 
 
233 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410558  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  27.46 
 
 
291 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  26.36 
 
 
605 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  26.19 
 
 
742 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  31.55 
 
 
351 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  27.41 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  33.33 
 
 
497 aa  75.1  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  26.91 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  34.97 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1993  protein of unknown function DUF323  25.08 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2020  protein of unknown function DUF323  25.08 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  25.51 
 
 
586 aa  74.3  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  27.95 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  29.95 
 
 
628 aa  73.9  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16100  hypothetical protein  33.01 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.719572  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  27.9 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  28.4 
 
 
781 aa  73.9  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  28.57 
 
 
751 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  32.2 
 
 
456 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0171  gliding motility-related protein  28.75 
 
 
344 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  30.8 
 
 
668 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  28.79 
 
 
296 aa  73.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0808  hypothetical protein  30.81 
 
 
395 aa  72  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.178792 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  24.66 
 
 
684 aa  72  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  28.57 
 
 
491 aa  71.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  32.3 
 
 
240 aa  72  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 
621 aa  72  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  27.68 
 
 
877 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  27.54 
 
 
892 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  31.46 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 
616 aa  71.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  26.07 
 
 
600 aa  71.2  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  27.67 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1263  protein of unknown function DUF323  25.19 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.211792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  25.82 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1865  protein of unknown function DUF323  27.65 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000544959  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  27.38 
 
 
620 aa  70.5  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  25.51 
 
 
639 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  26.74 
 
 
301 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0288  putative lipoprotein  30.33 
 
 
491 aa  70.5  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>