More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03306 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  100 
 
 
210 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.7 
 
 
207 aa  161  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.02 
 
 
207 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  41.76 
 
 
210 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.76 
 
 
210 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.76 
 
 
210 aa  158  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.76 
 
 
210 aa  158  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.38 
 
 
227 aa  158  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.56 
 
 
207 aa  157  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.19 
 
 
209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.69 
 
 
209 aa  155  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.18 
 
 
211 aa  154  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  41.04 
 
 
214 aa  154  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.19 
 
 
209 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0042  glutathione S-transferase-like  36.87 
 
 
196 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.422861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2769  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.17 
 
 
195 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 
210 aa  132  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.63 
 
 
205 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.58 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  31.05 
 
 
205 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.53 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0054  glutathione S-transferase like protein  34.86 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000644124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.05 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 
223 aa  114  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0408  glutathione S-transferase-like  31.66 
 
 
200 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.53035  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  35.21 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  34.48 
 
 
202 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  31 
 
 
202 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.99 
 
 
202 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  31.71 
 
 
216 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  32.49 
 
 
201 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  32.49 
 
 
201 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.79 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  30.33 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  31.47 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.61 
 
 
211 aa  92  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50056  predicted protein  29.77 
 
 
233 aa  91.7  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.466232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  31.37 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  30.24 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  31.07 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  30.05 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  30.05 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  28.71 
 
 
234 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.29 
 
 
214 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  30.2 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  32.38 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  32.14 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  31.77 
 
 
214 aa  87  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  28.28 
 
 
201 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 
204 aa  85.5  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2935  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.16 
 
 
210 aa  85.5  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  30.61 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  28.71 
 
 
222 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2345  glutathione S-transferase, putative  30.51 
 
 
234 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1119  putative glutathione S-transferase  30.51 
 
 
234 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3417  glutathione S-transferase, putative  30.51 
 
 
234 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0270497  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3410  putative glutathione S-transferase  30.51 
 
 
234 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0257  putative glutathione S-transferase  30.51 
 
 
234 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.17 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2523  putative glutathione S-transferase  30.51 
 
 
234 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  30.54 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3374  putative glutathione S-transferase  30.51 
 
 
234 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0444471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5316  Glutathione S-transferase domain  26.4 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.591495  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3528  glutathione S-transferase  31.82 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  30.18 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.12 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  26.57 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.63 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  29.41 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  29.52 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.18 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  29.56 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.17 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0794  Glutathione S-transferase domain  29.68 
 
 
221 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730011  normal  0.341274 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  29.08 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  27.72 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.92 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  31.66 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  31.48 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.28 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.44 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  29.85 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  26.53 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00195  Glutathione S-transferase-like protein  31.13 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.65 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  29.21 
 
 
184 aa  79  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  28.57 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  32.51 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  28.85 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  25 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  26.11 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4988  glutathione S-transferase-like protein  26.8 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2889  glutathione S-transferase-like  31.4 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.737778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  27.35 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  29.58 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>