More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01958 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4155  serine/threonine protein kinase  51.8 
 
 		 623 aa  650    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.922757  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1707  putative protein kinase  58.44 
 
 		 611 aa  743    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0579  serine/threonine protein kinase, putative  51.47 
 
 		 602 aa  663    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3729  serine/threonine protein kinase  51.3 
 
 		 602 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0586  serine/threonine protein kinase  50.98 
 
 		 609 aa  660    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4012  serine/threonine protein kinase  52.78 
 
 		 606 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000249675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3786  protein kinase  51.3 
 
 		 602 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0539  protein kinase  51.8 
 
 		 600 aa  649    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01958  Serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 624 aa  1296    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000150408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2040  serine/threonine protein kinase  66.56 
 
 		 616 aa  860    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.529884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0579  serine/threonine protein kinase  52.46 
 
 		 602 aa  668    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3451  serine/threonine protein kinase  51.95 
 
 		 602 aa  666    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0578  serine/threonine protein kinase  51.95 
 
 		 602 aa  666    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0541  serine/threonine protein kinase, putative  51.53 
 
 		 606 aa  657    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.89559  decreased coverage  0.00419942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1379  protein kinase  58.55 
 
 		 613 aa  746    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.688474  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0539  protein kinase  51.3 
 
 		 602 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3263  serine/threonine protein kinase  52.85 
 
 		 611 aa  670    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.507481  hitchhiker  0.00561071 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3912  protein kinase  51.3 
 
 		 602 aa  654    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3298  protein kinase  51.14 
 
 		 602 aa  654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3500  serine/threonine protein kinase  49.92 
 
 		 610 aa  633  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  23.25 
 
 		 662 aa  72.8  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  30.63 
 
 		 403 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 894 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  27.43 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0600  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 		 510 aa  67.4  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0109114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  27.33 
 
 		 427 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.7 
 
 		 746 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  33.56 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  24.92 
 
 		 866 aa  64.3  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  24.05 
 
 		 777 aa  64.3  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1579  serine/threonine protein kinase  24.63 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  28.22 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  24.38 
 
 		 614 aa  63.2  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4023  serine/threonine protein kinase  26.58 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.1 
 
 		 653 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  27.44 
 
 		 407 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 		 617 aa  62.4  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2237  serine/threonine protein kinase  27.21 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  24.44 
 
 		 1415 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2291  serine/threonine protein kinase  27.21 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.76151  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  22.84 
 
 		 621 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  25.1 
 
 		 623 aa  60.8  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  27.73 
 
 		 762 aa  60.8  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  25.88 
 
 		 651 aa  60.1  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1099  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 267 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000152305  hitchhiker  0.0000000000000203974 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.27 
 
 		 668 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  24.29 
 
 		 542 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5424  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 518 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178925  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4240  serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 		 541 aa  59.7  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  23.93 
 
 		 825 aa  58.9  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  23.79 
 
 		 982 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1529  protein kinase  26.15 
 
 		 774 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.87 
 
 		 822 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  25.72 
 
 		 622 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  23.33 
 
 		 634 aa  57.8  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  22.88 
 
 		 982 aa  57.4  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4391  Serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000198345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  24.06 
 
 		 608 aa  57  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  34.26 
 
 		 652 aa  57  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  24.66 
 
 		 985 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  25.44 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 		 766 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  20.89 
 
 		 692 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2487  serine/threonine protein kinase  24.73 
 
 		 377 aa  56.6  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000035224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.46 
 
 		 1780 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  24.8 
 
 		 357 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  27.16 
 
 		 586 aa  56.2  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  25.88 
 
 		 771 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  22.88 
 
 		 985 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 		 557 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6388  serine/threonine protein kinase  27.2 
 
 		 391 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  24.13 
 
 		 639 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 450 aa  55.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 332 aa  55.8  0.000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  24.13 
 
 		 639 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  25.68 
 
 		 666 aa  55.1  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.62 
 
 		 676 aa  55.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  24.28 
 
 		 888 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  25.57 
 
 		 915 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  23.93 
 
 		 642 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  24.28 
 
 		 781 aa  54.7  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4863  Serine/threonine protein kinase  30.59 
 
 		 534 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00126679  unclonable  0.000000230163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3142  serine/threonine protein kinase  24.78 
 
 		 499 aa  54.7  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0617984  normal  0.649612 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  20.89 
 
 		 691 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 		 483 aa  54.7  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.9 
 
 		 591 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8509  protein kinase  26.2 
 
 		 377 aa  54.7  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355272  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2948  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 		 638 aa  54.3  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7153  Serine/threonine protein kinase-like protein  25.09 
 
 		 531 aa  54.3  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.917924  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0111  serine/threonine protein kinase  26.15 
 
 		 526 aa  54.3  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.380254  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  23.25 
 
 		 625 aa  54.3  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.96 
 
 		 627 aa  53.9  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  22.51 
 
 		 612 aa  53.9  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.19 
 
 		 757 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 		 437 aa  53.9  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.564143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>