215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5571 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5571  putative transposase  100 
 
 
105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  62.24 
 
 
233 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  61.22 
 
 
233 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  59.18 
 
 
233 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  59.18 
 
 
233 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  59.18 
 
 
233 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  59.18 
 
 
233 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  59.18 
 
 
233 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  58.06 
 
 
233 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  56.99 
 
 
233 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  56.99 
 
 
233 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  56.99 
 
 
233 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  56.99 
 
 
233 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  54.84 
 
 
233 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  53.68 
 
 
237 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  55.32 
 
 
232 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  51.69 
 
 
237 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  51.69 
 
 
237 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  51.69 
 
 
237 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  51.69 
 
 
237 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  51.69 
 
 
237 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  51.69 
 
 
237 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  51.69 
 
 
237 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  50 
 
 
243 aa  94  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  51.06 
 
 
238 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  47.87 
 
 
238 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  47.87 
 
 
238 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  52.13 
 
 
180 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  50 
 
 
238 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  51.06 
 
 
238 aa  90.5  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  48.39 
 
 
237 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  46.81 
 
 
236 aa  87.8  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  46.81 
 
 
236 aa  87.8  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  46.81 
 
 
236 aa  87.8  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  48.45 
 
 
242 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  48.45 
 
 
242 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  48.45 
 
 
242 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  48.45 
 
 
242 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  48.45 
 
 
242 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  48.45 
 
 
242 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  45.74 
 
 
238 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  47.19 
 
 
251 aa  85.9  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  53.85 
 
 
238 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  53.85 
 
 
238 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  53.85 
 
 
238 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  53.85 
 
 
238 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  42.42 
 
 
236 aa  84.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  52.22 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  50.55 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  49.47 
 
 
236 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  49.47 
 
 
236 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7541  transposase  46.51 
 
 
119 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  51.11 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  50 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8072  transposase  45.24 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  48.35 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  48.35 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  31.96 
 
 
227 aa  73.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  46.15 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  46.15 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  46.15 
 
 
237 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.63 
 
 
230 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.63 
 
 
230 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  37.63 
 
 
230 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  37.63 
 
 
230 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  37.63 
 
 
206 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  51.28 
 
 
212 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  35.11 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  51.28 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  31.91 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  39.58 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  32.98 
 
 
228 aa  67  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  32.98 
 
 
228 aa  67  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  32.98 
 
 
228 aa  67  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  34.41 
 
 
181 aa  67  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  35.96 
 
 
226 aa  66.6  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  35.96 
 
 
226 aa  66.6  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  35.96 
 
 
226 aa  66.6  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  38.2 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  38.2 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  34.41 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1015  transposase  40.23 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.653024  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  34.83 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  40.45 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  38.2 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  38.2 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  37.08 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  37.08 
 
 
226 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  38.2 
 
 
226 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  38.2 
 
 
226 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  47.44 
 
 
213 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  37.08 
 
 
226 aa  63.9  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  34.83 
 
 
224 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  35.96 
 
 
224 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  40 
 
 
250 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  38.89 
 
 
246 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  34.83 
 
 
226 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  35.96 
 
 
224 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  35.96 
 
 
224 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.08 
 
 
346 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>