188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4675 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  55.5 
 
 
612 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  100 
 
 
615 aa  1233    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  40.26 
 
 
628 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2821  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  40.1 
 
 
626 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2865  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  40.1 
 
 
626 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2848  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  39.93 
 
 
645 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  31.48 
 
 
636 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  35.6 
 
 
570 aa  263  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  36.1 
 
 
605 aa  263  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  29.38 
 
 
644 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  28.77 
 
 
668 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  28 
 
 
668 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.37 
 
 
585 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  28.88 
 
 
677 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  27.35 
 
 
673 aa  145  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  27.91 
 
 
677 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  26.31 
 
 
569 aa  140  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.41 
 
 
625 aa  138  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.51 
 
 
550 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  23.76 
 
 
547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  24.72 
 
 
670 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  27.71 
 
 
714 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  25.91 
 
 
690 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  23.66 
 
 
641 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.78 
 
 
611 aa  130  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  26.35 
 
 
668 aa  130  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  26.44 
 
 
674 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  27.68 
 
 
704 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  27.45 
 
 
667 aa  127  9e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  26.98 
 
 
673 aa  126  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  28.09 
 
 
678 aa  126  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  24.26 
 
 
542 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  26.63 
 
 
677 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  27.13 
 
 
571 aa  123  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  26.12 
 
 
679 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  24.79 
 
 
670 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.63 
 
 
534 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  28.27 
 
 
677 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  25.22 
 
 
667 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.11 
 
 
587 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  24.78 
 
 
650 aa  117  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  26.55 
 
 
680 aa  117  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  25.58 
 
 
553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  28.88 
 
 
545 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  26.36 
 
 
668 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  27.43 
 
 
690 aa  115  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.41 
 
 
595 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.56 
 
 
550 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  25.58 
 
 
663 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  25.33 
 
 
705 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.82 
 
 
568 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  26.97 
 
 
674 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.43 
 
 
594 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.08 
 
 
580 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5443  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.01 
 
 
625 aa  108  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.26 
 
 
577 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  23.18 
 
 
540 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5294  peptidase S15  28.81 
 
 
599 aa  108  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  24.6 
 
 
667 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1942  putative acyl esterase  24.35 
 
 
558 aa  105  3e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395341  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  24.51 
 
 
670 aa  104  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  24.16 
 
 
670 aa  104  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  26.68 
 
 
595 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  25.13 
 
 
534 aa  104  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  25.13 
 
 
665 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  23.31 
 
 
625 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.56 
 
 
647 aa  100  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  23.91 
 
 
541 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  24.08 
 
 
541 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  24.07 
 
 
667 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  25 
 
 
667 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  25.31 
 
 
555 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.25 
 
 
524 aa  98.6  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.79 
 
 
599 aa  97.8  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07789  conserved hypothetical protein  23.57 
 
 
588 aa  97.4  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183202  normal  0.814624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  27.49 
 
 
549 aa  97.4  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.87 
 
 
546 aa  97.1  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1499  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.16 
 
 
604 aa  96.7  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124334  normal  0.885769 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  22.2 
 
 
618 aa  93.2  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1711  peptidase S15  26.86 
 
 
548 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.483969  normal  0.79803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  23.78 
 
 
598 aa  92.8  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0414  peptidase S15  34.84 
 
 
763 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  25.44 
 
 
560 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  26.52 
 
 
557 aa  91.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  24.7 
 
 
638 aa  90.1  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2030  peptidase S15  26.77 
 
 
547 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.743572  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  23.56 
 
 
793 aa  89.7  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  27.06 
 
 
558 aa  88.2  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  23.48 
 
 
529 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5053  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.06 
 
 
561 aa  87.4  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842061  normal  0.996249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  24.95 
 
 
679 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  27.84 
 
 
503 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  27.29 
 
 
576 aa  86.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  24.25 
 
 
551 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  24.25 
 
 
551 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2074  peptidase S15  24.25 
 
 
551 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1612  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2108  peptidase S15  37.27 
 
 
782 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681302  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  27.03 
 
 
499 aa  84.7  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.42 
 
 
561 aa  84  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  27 
 
 
571 aa  83.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>