More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0647 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  72.61 
 
 		 471 aa  675    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  63.68 
 
 		 476 aa  640    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 474 aa  946    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  90.93 
 
 		 474 aa  874    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  70.45 
 
 		 473 aa  667    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  72.77 
 
 		 473 aa  699    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  69.94 
 
 		 496 aa  677    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  79.32 
 
 		 474 aa  750    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  74.73 
 
 		 473 aa  701    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  72.22 
 
 		 473 aa  691    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  72.28 
 
 		 474 aa  685    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  71.91 
 
 		 473 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  71.15 
 
 		 474 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  71.91 
 
 		 473 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  91.56 
 
 		 474 aa  877    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  71.55 
 
 		 491 aa  695    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  70.88 
 
 		 473 aa  672    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  66.38 
 
 		 475 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  81.06 
 
 		 475 aa  763    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  70.24 
 
 		 473 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  79.32 
 
 		 474 aa  750    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  80.6 
 
 		 474 aa  762    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  63.83 
 
 		 490 aa  615  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  64.04 
 
 		 474 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 468 aa  567  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 487 aa  520  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 471 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 471 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 		 471 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 		 466 aa  504  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  57.72 
 
 		 490 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 479 aa  501  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  53.62 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 473 aa  435  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 465 aa  435  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 468 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 472 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 471 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 466 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 469 aa  415  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 473 aa  408  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 467 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 470 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 467 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 470 aa  402  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 472 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 472 aa  395  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 459 aa  395  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 479 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 475 aa  395  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 466 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 464 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 473 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 475 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 469 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 469 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 469 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 470 aa  388  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 464 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 474 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 474 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 474 aa  385  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>