More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0254 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 595 aa  1130    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  73.68 
 
 		 630 aa  827    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  73.52 
 
 		 630 aa  824    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  73.44 
 
 		 632 aa  808    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  77.74 
 
 		 629 aa  836    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  91.96 
 
 		 597 aa  974    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  58.23 
 
 		 594 aa  568  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1239  sodium/hydrogen exchanger  52.48 
 
 		 608 aa  545  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.333753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  49.05 
 
 		 591 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  48.45 
 
 		 593 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0454  sodium/hydrogen exchanger  44.58 
 
 		 594 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.400108  normal  0.559822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  47.83 
 
 		 592 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1572  sodium/hydrogen exchanger  47.83 
 
 		 591 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187931  decreased coverage  0.00050527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1281  sodium/hydrogen exchanger  42.3 
 
 		 594 aa  408  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119428  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  45.31 
 
 		 583 aa  395  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1965  sodium/hydrogen exchanger  43.56 
 
 		 594 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4566  sodium/hydrogen exchanger  46.17 
 
 		 578 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.218526 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  39.83 
 
 		 583 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  45.02 
 
 		 577 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.03 
 
 		 572 aa  340  2.9999999999999998e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  40.42 
 
 		 574 aa  340  5e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  41.16 
 
 		 590 aa  337  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  36.36 
 
 		 628 aa  335  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  37.07 
 
 		 569 aa  335  1e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.6 
 
 		 568 aa  334  2e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  36.36 
 
 		 628 aa  333  4e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.08 
 
 		 605 aa  330  6e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.25 
 
 		 602 aa  327  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.25 
 
 		 602 aa  326  8.000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.25 
 
 		 602 aa  326  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  35.51 
 
 		 649 aa  320  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4560  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.09 
 
 		 602 aa  319  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.460103 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1980  sodium/hydrogen exchanger  38.37 
 
 		 603 aa  318  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.846503  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  36.32 
 
 		 616 aa  317  6e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1861  hypothetical protein  35.5 
 
 		 601 aa  316  8e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  34.06 
 
 		 662 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2355  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.53 
 
 		 602 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14064  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1866  hypothetical protein  35.32 
 
 		 601 aa  315  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.1 
 
 		 613 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  35.76 
 
 		 650 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  37.77 
 
 		 602 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  36.77 
 
 		 649 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.93 
 
 		 613 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  35.69 
 
 		 648 aa  310  5e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  36.8 
 
 		 649 aa  309  9e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  35.47 
 
 		 620 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.47 
 
 		 620 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0377  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.16 
 
 		 602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3768  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.77 
 
 		 601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517058 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.47 
 
 		 620 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.47 
 
 		 620 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.47 
 
 		 620 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  35.47 
 
 		 620 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  38.31 
 
 		 668 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.47 
 
 		 620 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.35 
 
 		 621 aa  307  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.29 
 
 		 620 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.19 
 
 		 654 aa  306  7e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.29 
 
 		 620 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2542  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  37.87 
 
 		 605 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.72276  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  35.87 
 
 		 648 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  34.92 
 
 		 648 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2184  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  39.49 
 
 		 600 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000842132  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  36.11 
 
 		 660 aa  303  6.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.77 
 
 		 601 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  36.22 
 
 		 648 aa  302  9e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  36.22 
 
 		 648 aa  302  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  34.74 
 
 		 648 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.77 
 
 		 601 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.95 
 
 		 680 aa  302  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3762  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.77 
 
 		 601 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.581986  normal  0.282948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  35.03 
 
 		 653 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4259  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.44 
 
 		 607 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  38.14 
 
 		 678 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.59 
 
 		 601 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3653  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  37.77 
 
 		 601 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  36.88 
 
 		 661 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  36.88 
 
 		 661 aa  300  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  36.14 
 
 		 589 aa  300  6e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  34.74 
 
 		 648 aa  300  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.76 
 
 		 578 aa  299  9e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  37.68 
 
 		 668 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3845  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.54 
 
 		 603 aa  299  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4025  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.54 
 
 		 603 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  36.85 
 
 		 667 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  34.34 
 
 		 660 aa  298  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  37.68 
 
 		 668 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  37.68 
 
 		 668 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  36.01 
 
 		 648 aa  298  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 		 649 aa  296  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.34 
 
 		 620 aa  296  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  35.58 
 
 		 589 aa  296  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.34 
 
 		 620 aa  296  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  35.1 
 
 		 648 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  35.34 
 
 		 620 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  34.4 
 
 		 617 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00068  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.24 
 
 		 598 aa  295  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  37.63 
 
 		 666 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  35.58 
 
 		 589 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  36.09 
 
 		 533 aa  294  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>