More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3541 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3541  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  377  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000708449 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3843  hypothetical protein  63.27 
 
 		 199 aa  228  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3116  hypothetical protein  63.27 
 
 		 199 aa  227  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0747  hypothetical protein  61.66 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3726  hypothetical protein  56.93 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4435  lysine exporter protein LysE/YggA  60 
 
 		 199 aa  188  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4234  hypothetical protein  55.61 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.744826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0594  lysine exporter protein LysE/YggA  55.84 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0361  hypothetical protein  55.08 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2510  lysine exporter protein LysE/YggA  41.54 
 
 		 209 aa  131  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2346  hypothetical protein  41.33 
 
 		 212 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.22 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  34.03 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  37.77 
 
 		 225 aa  91.7  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  35.29 
 
 		 208 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  31.44 
 
 		 197 aa  89.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0298  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.68 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0672  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.6 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2788  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.18 
 
 		 197 aa  84.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0595509  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 		 203 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1967  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110071  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4342  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.04 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.701026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  28.09 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  32.98 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4474  lysine exporter protein LysE/YggA  31.69 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  28.09 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  35.16 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  28.35 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  28.09 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  28.09 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  28.09 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.05 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  32.04 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  28.09 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  32.46 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  32.46 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.09 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  32.46 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  32.46 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  28.09 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  32.46 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  28.09 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  32.46 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  29.44 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2526  lysine exporter protein LysE/YggA  30.6 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.332497  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  34.07 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2929  transporter, LysE family  29.23 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241119 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  34.07 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  34.07 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2480  amino acid transporter LysE  27.18 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00208965  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4317  lysine exporter protein LysE/YggA  32.28 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381114  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  28.04 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  31.32 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2253  lysine exporter protein LysE/YggA  29.74 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2478  hypothetical protein  34.2 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.609748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  30.68 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  30.68 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0257  lysine exporter protein LysE/YggA  29.74 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3939  LysE family translocator protein  29.74 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3696  LysE family translocator protein  29.74 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2278  amino acid transporter LysE  27.14 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0428766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2238  amino acid transporter LysE  27.14 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00601347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2447  amino acid transporter LysE  27.14 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2462  transporter, LysE family  27.14 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  30.11 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  29.03 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  34.01 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  28.98 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  32.46 
 
 		 640 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2541  transporter, LysE family  28.21 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  26.7 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2196  amino acid transporter LysE  27.69 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.184149  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  30.11 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  32.46 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  36.69 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  32.43 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10300  putative efflux protein  33.5 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0350881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  29.1 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  30.46 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  39.13 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  32.29 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2265  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.499699  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0374  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.1 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  32.31 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  29.71 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2015  hypothetical protein  29.24 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>