More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1835 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  47 
 
 		 826 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  45.12 
 
 		 805 aa  670    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  61.03 
 
 		 799 aa  818    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  48.8 
 
 		 803 aa  700    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  45.64 
 
 		 794 aa  673    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  59.64 
 
 		 790 aa  839    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  47.73 
 
 		 840 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  60.77 
 
 		 748 aa  761    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  45.38 
 
 		 805 aa  696    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  51.77 
 
 		 791 aa  734    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0031  heavy metal translocating P-type ATPase  60.7 
 
 		 747 aa  712    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  46.12 
 
 		 817 aa  676    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  61.41 
 
 		 732 aa  784    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  45.6 
 
 		 798 aa  662    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  45 
 
 		 805 aa  669    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  45.12 
 
 		 805 aa  667    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  45.12 
 
 		 805 aa  670    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  59.55 
 
 		 1061 aa  836    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  48.3 
 
 		 837 aa  654    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 804 aa  1564    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  60.41 
 
 		 732 aa  786    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  60.49 
 
 		 745 aa  721    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  45.38 
 
 		 806 aa  676    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  65.75 
 
 		 739 aa  807    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  48.89 
 
 		 826 aa  639    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  64.24 
 
 		 819 aa  876    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  61.78 
 
 		 741 aa  781    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  65.73 
 
 		 790 aa  924    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  46.21 
 
 		 815 aa  722    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  59.91 
 
 		 1061 aa  842    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  52.92 
 
 		 823 aa  711    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  45.06 
 
 		 797 aa  693    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  59.19 
 
 		 797 aa  823    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  46.83 
 
 		 798 aa  700    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  45.12 
 
 		 805 aa  669    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  59.79 
 
 		 1063 aa  839    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  61.7 
 
 		 1040 aa  879    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  61.03 
 
 		 799 aa  818    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  58.82 
 
 		 872 aa  858    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  45 
 
 		 805 aa  669    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  61.23 
 
 		 937 aa  856    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  50.62 
 
 		 801 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1894  heavy metal translocating P-type ATPase  54.9 
 
 		 754 aa  639    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  61.21 
 
 		 799 aa  843    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  57.14 
 
 		 971 aa  813    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  46.08 
 
 		 885 aa  645    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  48.37 
 
 		 837 aa  665    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  59.67 
 
 		 1061 aa  838    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  58.37 
 
 		 757 aa  741    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  46.92 
 
 		 821 aa  660    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  53.59 
 
 		 724 aa  721    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  45.51 
 
 		 802 aa  686    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  61.52 
 
 		 730 aa  780    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  61.52 
 
 		 730 aa  780    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  65.16 
 
 		 816 aa  894    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  59.51 
 
 		 795 aa  790    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  53.64 
 
 		 793 aa  818    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  45.6 
 
 		 798 aa  662    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  65.24 
 
 		 813 aa  937    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  60.24 
 
 		 767 aa  723    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  48.97 
 
 		 827 aa  653    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  45.51 
 
 		 802 aa  686    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3524  heavy metal translocating P-type ATPase  63 
 
 		 813 aa  857    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  51.97 
 
 		 758 aa  696    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  49.03 
 
 		 838 aa  654    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  48.67 
 
 		 836 aa  677    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  48.61 
 
 		 833 aa  643    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  48.98 
 
 		 841 aa  667    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  46.94 
 
 		 852 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  61.24 
 
 		 1021 aa  880    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  59.67 
 
 		 1063 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  59.67 
 
 		 1061 aa  838    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  62.03 
 
 		 1182 aa  874    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  57.92 
 
 		 782 aa  763    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  47.31 
 
 		 855 aa  656    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  61.67 
 
 		 835 aa  883    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  47.88 
 
 		 794 aa  648    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  60.52 
 
 		 1013 aa  867    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  47.77 
 
 		 797 aa  706    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  47.5 
 
 		 799 aa  666    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  49.62 
 
 		 793 aa  647    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  62.29 
 
 		 946 aa  872    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  62.48 
 
 		 792 aa  857    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  70.48 
 
 		 817 aa  1071    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  48.82 
 
 		 849 aa  642    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  62.11 
 
 		 740 aa  793    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1058  heavy metal translocating P-type ATPase  56.6 
 
 		 754 aa  673    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  61.24 
 
 		 1021 aa  880    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  61.34 
 
 		 800 aa  829    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  45.62 
 
 		 806 aa  674    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  48.7 
 
 		 743 aa  694    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  45.38 
 
 		 806 aa  672    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  43.27 
 
 		 796 aa  657    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  57.92 
 
 		 782 aa  764    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  62.1 
 
 		 792 aa  854    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  54.68 
 
 		 789 aa  779    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1340  copper-translocating P-type ATPase  43.98 
 
 		 796 aa  633  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  47.49 
 
 		 833 aa  634  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  41.05 
 
 		 889 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  47.49 
 
 		 814 aa  634  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>