More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2385 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 115 aa  232  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  77.12 
 
 		 118 aa  181  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  77.97 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  72.65 
 
 		 117 aa  174  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  72.03 
 
 		 118 aa  170  6.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  70.59 
 
 		 119 aa  169  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  72.03 
 
 		 118 aa  168  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  68.33 
 
 		 120 aa  155  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  68.33 
 
 		 120 aa  155  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  67.5 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  67.5 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  67.5 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  67.5 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  67.5 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  67.5 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  67.5 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  63.87 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  66.67 
 
 		 120 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  63.87 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  66.67 
 
 		 120 aa  151  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  62.5 
 
 		 120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  62.18 
 
 		 119 aa  150  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  66.96 
 
 		 125 aa  147  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  62.5 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  61.48 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  59.02 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  60.83 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  62.3 
 
 		 122 aa  140  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  57.98 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  57.98 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  64.86 
 
 		 114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  61.74 
 
 		 115 aa  135  1e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  59.84 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  56.56 
 
 		 122 aa  133  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  58.47 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  57.5 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  57.26 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  59.5 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  58.12 
 
 		 117 aa  127  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  53.28 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 		 124 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  59.09 
 
 		 118 aa  126  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  62.04 
 
 		 124 aa  126  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 122 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  51.61 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  57.27 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  61.82 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  59.8 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 		 120 aa  124  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  51.22 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  62.04 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  56.25 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 119 aa  120  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  52.89 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  62.14 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 116 aa  120  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  59.09 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  66.34 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  57.94 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  57.41 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  61.47 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  58.49 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  60.36 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  64.29 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  60.36 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  60.95 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  61.26 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  56.25 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  53.15 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  53.72 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  52.54 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  53.72 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  57.38 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  53.72 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  57.27 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  59.46 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  58.18 
 
 		 123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  62.63 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  56.41 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  55.45 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>