More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  100 
 
 		 439 aa  886    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  66.59 
 
 		 438 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  64.17 
 
 		 429 aa  549  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  63.04 
 
 		 431 aa  543  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  62.39 
 
 		 448 aa  542  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  61.82 
 
 		 436 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  63.49 
 
 		 432 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  61.36 
 
 		 436 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  61.31 
 
 		 437 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  65.24 
 
 		 436 aa  529  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  60 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  58.56 
 
 		 438 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  58.73 
 
 		 429 aa  521  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  58.48 
 
 		 441 aa  520  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  58.52 
 
 		 441 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  58.24 
 
 		 437 aa  510  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  58.56 
 
 		 436 aa  504  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  59.01 
 
 		 436 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  58.96 
 
 		 435 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  58.6 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  57.94 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  58.18 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  56.11 
 
 		 437 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  58.46 
 
 		 449 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  54.95 
 
 		 441 aa  488  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  55.58 
 
 		 441 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  55.58 
 
 		 441 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  55.58 
 
 		 441 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  55.78 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  54.22 
 
 		 445 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  55.1 
 
 		 430 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  54.36 
 
 		 441 aa  474  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  56.76 
 
 		 435 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  53.8 
 
 		 457 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  54.36 
 
 		 445 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  54.22 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1727  preprotein translocase subunit SecY  53.86 
 
 		 445 aa  463  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000416171  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  52.27 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0271  preprotein translocase, SecY subunit  52.05 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  53.59 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  49.1 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  48.41 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  46.21 
 
 		 423 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  48.87 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.2 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  46.44 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  44.9 
 
 		 447 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  44.9 
 
 		 447 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  45.21 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  44.77 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  46.21 
 
 		 437 aa  363  4e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  45.78 
 
 		 435 aa  361  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  45.56 
 
 		 429 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  44.42 
 
 		 447 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.47 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  44.35 
 
 		 437 aa  358  8e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  45.09 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  45.37 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  44.32 
 
 		 435 aa  356  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  44.67 
 
 		 420 aa  352  5.9999999999999994e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  42.48 
 
 		 426 aa  351  2e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  44.02 
 
 		 443 aa  351  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  44.1 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  43.47 
 
 		 443 aa  349  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 		 444 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  43.02 
 
 		 449 aa  347  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  43.92 
 
 		 448 aa  347  3e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  44.74 
 
 		 419 aa  346  5e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  43.43 
 
 		 421 aa  346  5e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  45.16 
 
 		 438 aa  345  7e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  43.6 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  43.65 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  42.89 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  0.0000395879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  45.16 
 
 		 443 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  40.52 
 
 		 446 aa  342  9e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  43.44 
 
 		 426 aa  342  1e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000440606  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.5 
 
 		 442 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  44.12 
 
 		 446 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  44.6 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  44.6 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  43.5 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  44.14 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  43.11 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  43.02 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  43.72 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  41.57 
 
 		 418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  43.92 
 
 		 446 aa  336  5e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  40.77 
 
 		 448 aa  336  5.999999999999999e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  42.34 
 
 		 424 aa  335  5.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  43.43 
 
 		 437 aa  335  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  44.5 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  43.53 
 
 		 443 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  44.87 
 
 		 421 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  43.69 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  43.58 
 
 		 443 aa  333  4e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  45.17 
 
 		 431 aa  333  4e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  43.18 
 
 		 443 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  43.93 
 
 		 448 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  43.02 
 
 		 447 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  43.24 
 
 		 443 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>