More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02280 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_02280  Pirin-related protein  100 
 
 
335 aa  670    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2745  Pirin domain-containing protein  51.34 
 
 
319 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.211686  normal  0.964257 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0788  pirin domain-containing protein  50.3 
 
 
321 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3190  Pirin domain protein  47.71 
 
 
351 aa  289  6e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23410  Pirin-related protein  48.51 
 
 
348 aa  288  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0699691  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  47.89 
 
 
381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  52.54 
 
 
351 aa  286  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0062  pirin domain-containing protein  48.52 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  50.15 
 
 
335 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4144  Pirin domain protein  50.87 
 
 
329 aa  281  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.173069  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  48.83 
 
 
329 aa  280  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3633  Pirin domain protein  49.42 
 
 
330 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3726  Pirin domain protein  47.54 
 
 
336 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5391  pirin domain-containing protein  50.62 
 
 
317 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5681  pirin domain-containing protein  50.62 
 
 
317 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5302  Pirin-like protein  50.62 
 
 
317 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.178895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  42.86 
 
 
343 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2844  pirin domain-containing protein  39.52 
 
 
363 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.923717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2245  hypothetical protein  42.94 
 
 
332 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169099  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1645  Pirin domain protein  40.12 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2558  Pirin domain protein  43.57 
 
 
336 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000413123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0490  Pirin domain protein  44.9 
 
 
322 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0687764  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3476  Pirin domain protein  41.76 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.944311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  41.95 
 
 
301 aa  189  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0919  pirin domain-containing protein  37.95 
 
 
338 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200809  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  40.59 
 
 
313 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  40.2 
 
 
332 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  40.2 
 
 
315 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  37.28 
 
 
307 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  37.87 
 
 
301 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  36.92 
 
 
308 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  36.92 
 
 
307 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  35.13 
 
 
307 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  35.13 
 
 
307 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  36.79 
 
 
313 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  35.13 
 
 
307 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0053  pirin domain-containing protein  33.79 
 
 
307 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  36.88 
 
 
306 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  34.77 
 
 
307 aa  156  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  36.69 
 
 
297 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  35.26 
 
 
307 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  34.98 
 
 
307 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  37.87 
 
 
290 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  37.73 
 
 
291 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  35.86 
 
 
306 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  38.13 
 
 
291 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0649  Pirin-like protein  38.8 
 
 
294 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  35.23 
 
 
305 aa  149  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  35.69 
 
 
312 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  38.87 
 
 
293 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  38.87 
 
 
293 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  35.08 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  35.08 
 
 
312 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  37.5 
 
 
296 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  34.83 
 
 
306 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  39.22 
 
 
293 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  36.9 
 
 
304 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  36.76 
 
 
309 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  38.79 
 
 
293 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  36.82 
 
 
291 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2589  pirin domain-containing protein  38.21 
 
 
293 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437288  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1817  pirin-like protein  34.69 
 
 
312 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123159  normal  0.257408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  37.71 
 
 
293 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  36 
 
 
293 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  37.01 
 
 
304 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  34.69 
 
 
307 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  36.96 
 
 
291 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  30.6 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  37.59 
 
 
291 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  36.46 
 
 
340 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  38.52 
 
 
294 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  37.87 
 
 
301 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  32.72 
 
 
311 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  36.36 
 
 
301 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0421  pirin domain-containing protein  37.92 
 
 
298 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2513  Pirin-like  33.95 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0731  pirin domain-containing protein  37.68 
 
 
293 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  35.29 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  35.66 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  35.42 
 
 
296 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  36.52 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  36.86 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  35.71 
 
 
307 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  31.62 
 
 
310 aa  133  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  32.97 
 
 
311 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  36.82 
 
 
293 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2304  pirin domain-containing protein  32.14 
 
 
310 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000453876  normal  0.0236921 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  37.09 
 
 
299 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  34.32 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  31.76 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  35.42 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0364  pirin domain-containing protein  35.25 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.372355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  36.82 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3510  pirin domain-containing protein  32.52 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  36.82 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  35.71 
 
 
294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  35.06 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  34.69 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  34.3 
 
 
289 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  35.66 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>