More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4180 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  51.57 
 
 		 249 aa  235  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  50.5 
 
 		 363 aa  194  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  49.51 
 
 		 286 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  46.01 
 
 		 256 aa  191  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  47.32 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  47.32 
 
 		 237 aa  188  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  47.39 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  44.33 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  42.47 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  43.75 
 
 		 277 aa  175  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  49.72 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  42.44 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.2 
 
 		 240 aa  155  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  45.08 
 
 		 458 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  42.41 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1552  DedA family membrane protein  41.46 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.487737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  37.44 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  37.61 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.57 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  41.71 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  41.57 
 
 		 220 aa  133  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.4 
 
 		 201 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  41.58 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  41.04 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  38.46 
 
 		 219 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  37.98 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  36.15 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  37.98 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  37.98 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  37.98 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  37.29 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.56 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  37.95 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.35 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  38.46 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 224 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  37.11 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.11 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  37.11 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  40.8 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  37.11 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  37.11 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  38.73 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  37.11 
 
 		 219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  35.02 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  42.86 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  38.55 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  37.95 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  36.67 
 
 		 241 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  46.31 
 
 		 198 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  36.6 
 
 		 219 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  36.6 
 
 		 219 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  37.95 
 
 		 221 aa  124  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  36.6 
 
 		 219 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  36.41 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  40.56 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.57 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  36.92 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  35.39 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  37.14 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  37.57 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  37.14 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  37.14 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  40.83 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.2 
 
 		 213 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  40.24 
 
 		 230 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  37.57 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  39.15 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  39.2 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  36.73 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  39.15 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  37.02 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  39.77 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.24 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  38.42 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  37.8 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.14 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  37.23 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  39.39 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  34.43 
 
 		 216 aa  119  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  37.87 
 
 		 201 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  36.6 
 
 		 227 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  35.91 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  36.41 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  42.21 
 
 		 213 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  36.41 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  36.41 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  38.64 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.87 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  36.36 
 
 		 213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  39.29 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  34.24 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  37.93 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  35.93 
 
 		 214 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  39.29 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  34.02 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  42.02 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  35.29 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  35.33 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>