More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1057 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
259 aa  538  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  56.7 
 
 
273 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  46.02 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  39.15 
 
 
231 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  40.62 
 
 
394 aa  148  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
298 aa  126  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  39.73 
 
 
378 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 
394 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.56 
 
 
382 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  37.16 
 
 
411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  37.76 
 
 
412 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
420 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  36.73 
 
 
406 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 
430 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
414 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  39.27 
 
 
480 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  37.1 
 
 
414 aa  99.8  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
226 aa  99  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  37.67 
 
 
410 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
229 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
314 aa  97.4  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
307 aa  96.3  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
374 aa  95.1  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
304 aa  94  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  39.27 
 
 
559 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
386 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  31.02 
 
 
310 aa  91.3  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  35.81 
 
 
410 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
312 aa  90.5  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
321 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.35 
 
 
410 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1563  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
252 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.633792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  32.07 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
250 aa  86.3  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
389 aa  85.5  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
230 aa  85.1  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  45.83 
 
 
694 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10550  dolichyl-phosphate sugar synthase  33.97 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0345787  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
303 aa  84  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2922  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.895357  hitchhiker  0.00151129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0979  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.19 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4853  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1719  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530897  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  31.67 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  33.33 
 
 
1148 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 
244 aa  79  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5467  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
418 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66803  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  29.95 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  0.000000773119 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2272  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.632375  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  27.65 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0825  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
251 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
472 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  31.05 
 
 
574 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
305 aa  75.5  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.64 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>