More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0560 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 265 aa  533  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  49.24 
 
 		 265 aa  244  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  42.53 
 
 		 264 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  47.08 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  40.52 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  40.84 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  39.93 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  39.31 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  40.45 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.15 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  37.64 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.96 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  33.21 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  36.64 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.4 
 
 		 290 aa  142  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  34.44 
 
 		 273 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  32.95 
 
 		 271 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  32.95 
 
 		 271 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  36.67 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  32.95 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  32.58 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  37.12 
 
 		 281 aa  139  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.87 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  31.6 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  34.81 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.96 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  35.74 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  30.74 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  31.62 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  25.46 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  31.32 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  31.73 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.25 
 
 		 308 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  30.47 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  29.37 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  30.08 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  27.47 
 
 		 281 aa  90.1  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  27.41 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  23.47 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  24.91 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  30.66 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  27.11 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  25.81 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  24.15 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  24.15 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  27.14 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  28.78 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.44 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  26.22 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  24.62 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  27.96 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  26.92 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  28.94 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  28.04 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  27.17 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  25.56 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  28.94 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.16 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  30.82 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  22.22 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  22.18 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  28.21 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  25.37 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  24.63 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.76 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.324919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.18 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  25.37 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.37 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.37 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  25.37 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  25.37 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  25.37 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  24.63 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  26.14 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  25.09 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  25.61 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.57 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  23.86 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  22.81 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1882  HAD superfamily hydrolase  26.27 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  28.78 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  30.08 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  28.47 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  26.33 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.87 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  25.72 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  28.4 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  30.25 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  23.86 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  26.59 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2879  phosphotransferase  25.72 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.17 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  23.36 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1811  Cof-like hydrolase  26.5 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  28.47 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  28.47 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  25.83 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  28.47 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  28.47 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>