More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0203 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  100 
 
 
301 aa  610  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  58.8 
 
 
299 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  58 
 
 
300 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  57.33 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  58.31 
 
 
296 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  55.78 
 
 
292 aa  326  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  53.95 
 
 
299 aa  315  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  51.01 
 
 
297 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  52.83 
 
 
326 aa  280  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  50.34 
 
 
288 aa  277  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  49.84 
 
 
306 aa  277  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  48.84 
 
 
297 aa  269  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  47.21 
 
 
303 aa  267  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  47.97 
 
 
293 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  47.97 
 
 
293 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  46.84 
 
 
296 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  47.28 
 
 
293 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  47.64 
 
 
293 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  48.14 
 
 
292 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  50 
 
 
297 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  47.28 
 
 
293 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  49.49 
 
 
303 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  47.51 
 
 
319 aa  256  3e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  45.58 
 
 
293 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  46.58 
 
 
293 aa  256  5e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  47.62 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  48.68 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  44.59 
 
 
298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  47.49 
 
 
315 aa  253  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  46.42 
 
 
294 aa  252  6e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  45.97 
 
 
296 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  47.81 
 
 
296 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  47.24 
 
 
294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  43.3 
 
 
296 aa  235  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  41.44 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  47.3 
 
 
298 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  41.41 
 
 
292 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  45.24 
 
 
306 aa  222  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  42.76 
 
 
304 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  47.7 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  47.7 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  43.29 
 
 
306 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  47.04 
 
 
300 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  43.18 
 
 
295 aa  217  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  41.72 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  42.41 
 
 
298 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  42 
 
 
279 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  42.47 
 
 
307 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  42.61 
 
 
292 aa  209  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  41.53 
 
 
323 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  38.06 
 
 
281 aa  208  1e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  41.08 
 
 
295 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  42 
 
 
279 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  41.28 
 
 
286 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  43.23 
 
 
309 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  42.81 
 
 
298 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  42.57 
 
 
298 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  42.57 
 
 
298 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  42.09 
 
 
284 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  45.53 
 
 
305 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  38.31 
 
 
288 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  42.32 
 
 
289 aa  202  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  40.61 
 
 
291 aa  201  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  40.33 
 
 
306 aa  202  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  39.87 
 
 
310 aa  201  9e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  40.24 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  41.41 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  47.46 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  40.47 
 
 
293 aa  199  6e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  41 
 
 
282 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  38.18 
 
 
272 aa  198  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  42.47 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  40.14 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  39.66 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  41.41 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  41.12 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  43.04 
 
 
306 aa  196  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  37.38 
 
 
305 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  39.87 
 
 
278 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  39.8 
 
 
302 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  40.48 
 
 
284 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  38.18 
 
 
283 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  37.79 
 
 
289 aa  194  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  40.34 
 
 
292 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  37.84 
 
 
283 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  37.5 
 
 
283 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  45.61 
 
 
287 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  40.34 
 
 
292 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  40.34 
 
 
292 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  42.48 
 
 
309 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  40.34 
 
 
292 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  40.93 
 
 
257 aa  193  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4540  chromosome segregation DNA-binding protein  37.16 
 
 
333 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  37.5 
 
 
283 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  40.54 
 
 
272 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  39.67 
 
 
314 aa  192  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  39.86 
 
 
288 aa  192  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  39.86 
 
 
290 aa  192  7e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  38.18 
 
 
283 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  39.25 
 
 
295 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>