More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_2065 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_2065  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
118 aa  232  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1859  50S ribosomal protein L18  99.15 
 
 
118 aa  230  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1688  50S ribosomal protein L18  99.15 
 
 
118 aa  230  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.949463  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0075  50S ribosomal protein L18  89.83 
 
 
118 aa  211  3.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.820764  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1760  50S ribosomal protein L18  75.42 
 
 
118 aa  160  6e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00341283  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1952  ribosomal protein L18  66.1 
 
 
118 aa  159  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1017  50S ribosomal protein L18  72.88 
 
 
118 aa  156  9e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000395061  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0100  50S ribosomal protein L18  61.86 
 
 
118 aa  152  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0050  50S ribosomal protein L18  68.64 
 
 
118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.341657  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0302  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.488983  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
117 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  46.36 
 
 
119 aa  100  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  47.66 
 
 
115 aa  99.4  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  47.22 
 
 
116 aa  95.9  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  44.95 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  44.64 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1558  ribosomal protein L18  50.45 
 
 
121 aa  94.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000783356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  44.44 
 
 
122 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  44.95 
 
 
120 aa  94  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  43.59 
 
 
122 aa  94  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  44.14 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  46.36 
 
 
118 aa  92  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  43.97 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  41.96 
 
 
120 aa  90.5  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  42.11 
 
 
116 aa  90.5  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  46.08 
 
 
117 aa  90.1  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  45.95 
 
 
112 aa  90.5  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  43.86 
 
 
121 aa  90.5  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 
120 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  42.2 
 
 
118 aa  88.6  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  43.93 
 
 
114 aa  88.6  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  41.28 
 
 
118 aa  87.8  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  42.73 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  40.91 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 
120 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  43.64 
 
 
114 aa  87  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  40.54 
 
 
119 aa  87.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0505  50S ribosomal protein L18  48.42 
 
 
119 aa  87  8e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  40 
 
 
137 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  47.22 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  40 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  40.37 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  40.91 
 
 
120 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  42.48 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  40.34 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  40.71 
 
 
122 aa  84.7  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  43.24 
 
 
120 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  40.17 
 
 
117 aa  84  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf425  ribosomal protein L18  45.74 
 
 
115 aa  84  7e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  44.33 
 
 
116 aa  82.8  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  42.34 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  42.2 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  42.2 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  41.67 
 
 
118 aa  82  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  40.19 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3989  ribosomal protein L18  40.54 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0949  50S ribosomal protein L18  43.59 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  39.82 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16290  Plastid ribosomal protein L18 large ribosomal subunit  37.07 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0898056 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1362  ribosomal protein L18  41.74 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  38.89 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  37.72 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  39.66 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  40 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  36.67 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  37.82 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  37.82 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  42.2 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  40.91 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  42.34 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  40.91 
 
 
120 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  40.37 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  40.54 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  38.05 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_002620  TC0800  50S ribosomal protein L18  34.45 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00718139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  37.82 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  37.72 
 
 
124 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  40 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  35.54 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  36.61 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1356  ribosomal protein L18  44.09 
 
 
117 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  35.9 
 
 
119 aa  77  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  38.66 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  41.07 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0270  50S ribosomal protein L18  40.87 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0524919  normal  0.432762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  37.72 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  39.32 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  39.47 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  38.89 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  39.64 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  40.54 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  39.81 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>