More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0050 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0050  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 118 aa  234  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.341657  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0100  50S ribosomal protein L18  77.12 
 
 		 118 aa  183  8e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0075  50S ribosomal protein L18  72.88 
 
 		 118 aa  177  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.820764  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1859  50S ribosomal protein L18  69.49 
 
 		 118 aa  170  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1688  50S ribosomal protein L18  69.49 
 
 		 118 aa  170  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.949463  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2065  50S ribosomal protein L18  68.64 
 
 		 118 aa  168  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1017  50S ribosomal protein L18  76.27 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000395061  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1760  50S ribosomal protein L18  77.12 
 
 		 118 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00341283  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1952  ribosomal protein L18  62.71 
 
 		 118 aa  149  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0302  50S ribosomal protein L18  60.17 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.488983  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  49.53 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  46.3 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  46.9 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  43.09 
 
 		 120 aa  100  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  51.38 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  45 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  42.86 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  44.14 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  42.11 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  44.54 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  43.12 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  43.12 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  42.59 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  44.44 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  43.33 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  42.11 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  42.11 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  42.11 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  42.11 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  42.11 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  42.02 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  42.11 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  42.02 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  41.23 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  42.11 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  45.92 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  44.92 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  50.93 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  43.86 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  44.04 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  41.23 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  43.1 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  42.02 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  41.23 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  42.24 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  40.5 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  40.5 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  42.98 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  45.45 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  43.93 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  43.86 
 
 		 118 aa  90.5  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  42.59 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1558  ribosomal protein L18  47.75 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000783356  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  47.06 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  43.12 
 
 		 119 aa  89.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  40.16 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  47.86 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  42.86 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  44.55 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  42.48 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  39.67 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  41.03 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  42.02 
 
 		 122 aa  87.8  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  41.82 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  43.24 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  42.73 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  41.59 
 
 		 120 aa  87  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  44.25 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  41.44 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  39.83 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0949  50S ribosomal protein L18  37.59 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  41.59 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  41.18 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  41.07 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16290  Plastid ribosomal protein L18 large ribosomal subunit  40.52 
 
 		 123 aa  85.5  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0898056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  39.47 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  42.34 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  46.39 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  37.82 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  36.97 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  41.59 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  43.27 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  39.64 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  46.23 
 
 		 116 aa  83.6  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  44.35 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  38.39 
 
 		 122 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  40.87 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  39.82 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  36.52 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  36.97 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  43.56 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  40.83 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  42.86 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  40.54 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  40.54 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  40.54 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  37.93 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  40.38 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>