49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1450 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 		 192 aa  393  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  66.11 
 
 		 186 aa  258  5.0000000000000005e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  54.14 
 
 		 189 aa  214  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  40.37 
 
 		 171 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  38.89 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.79 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  31.25 
 
 		 169 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  41.36 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  37.57 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  39.88 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  35.15 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.25 
 
 		 165 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.32 
 
 		 173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  34.78 
 
 		 162 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  40.24 
 
 		 169 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.33 
 
 		 170 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  32.96 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.55 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  37.04 
 
 		 162 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.37 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  35.54 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.1 
 
 		 163 aa  102  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.71 
 
 		 178 aa  96.7  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  34.97 
 
 		 161 aa  96.7  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.67 
 
 		 158 aa  95.1  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  33.53 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  29.56 
 
 		 167 aa  94  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  31.9 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.49 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.99 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  29.61 
 
 		 180 aa  85.9  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.83 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.98 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  32.72 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  30.49 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  30.06 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  25 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  30.3 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  28.75 
 
 		 169 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  27.44 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  27.33 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  27.71 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.48 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  27.61 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  26.92 
 
 		 127 aa  48.5  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.53 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  31.03 
 
 		 200 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  28.75 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>