41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0851 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.11 
 
 
180 aa  114  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  28.17 
 
 
179 aa  61.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  25.29 
 
 
194 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  24.73 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  29.37 
 
 
174 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  28.08 
 
 
186 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  29.37 
 
 
170 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  28.67 
 
 
217 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  23.86 
 
 
174 aa  52  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  24.64 
 
 
186 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  26.2 
 
 
189 aa  51.6  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  26.92 
 
 
188 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  25.68 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  27.94 
 
 
229 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  25.68 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  25.68 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  34 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  22.3 
 
 
183 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  23.76 
 
 
191 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.34 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  30.25 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.29 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.36 
 
 
210 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  28.07 
 
 
186 aa  45.1  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 
179 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  25.14 
 
 
182 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  27.66 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  27.41 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.29 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  26.06 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  26.06 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  26.06 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  25.57 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  23.43 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  27.22 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.65 
 
 
191 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3028  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 
118 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970861  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1750  alkylhydroperoxidase  28.83 
 
 
132 aa  41.6  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430274  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>