More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11310 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 398 aa  811    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1361  tryptophan synthase subunit beta  74.28 
 
 		 391 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.059714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1440  tryptophan synthase subunit beta  67.18 
 
 		 386 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000281264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2939  tryptophan synthase subunit beta  66.16 
 
 		 387 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  65.27 
 
 		 409 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 		 391 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2482  tryptophan synthase subunit beta  63.82 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  63.64 
 
 		 397 aa  532  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  63.87 
 
 		 396 aa  531  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  63.66 
 
 		 414 aa  528  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3288  tryptophan synthase subunit beta  63.57 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  64.92 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  62.28 
 
 		 409 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 405 aa  521  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  64.57 
 
 		 414 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  62.63 
 
 		 402 aa  518  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  61.78 
 
 		 402 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  64.25 
 
 		 399 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  64.25 
 
 		 399 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  62.79 
 
 		 401 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  62.5 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  64.66 
 
 		 395 aa  518  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  62.08 
 
 		 394 aa  521  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  64.14 
 
 		 440 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  61.14 
 
 		 396 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  64.83 
 
 		 393 aa  515  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0925  tryptophan synthase subunit beta  61.66 
 
 		 396 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.7410900000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  64.34 
 
 		 399 aa  510  1e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  61.98 
 
 		 394 aa  510  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  62.04 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  61.3 
 
 		 403 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1757  tryptophan synthase subunit beta  63.31 
 
 		 402 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000013956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  61.42 
 
 		 401 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 394 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 394 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  60.81 
 
 		 407 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 404 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 397 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  60.57 
 
 		 400 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1558  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 406 aa  504  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  61.78 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  61.2 
 
 		 412 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  61.2 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 397 aa  502  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  60.05 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  59.07 
 
 		 411 aa  501  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  60.68 
 
 		 397 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 402 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 		 397 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  61.54 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 402 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  60.94 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  61.26 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  59.17 
 
 		 410 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  60.72 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 406 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  60.72 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  60.1 
 
 		 411 aa  498  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  60.99 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  61.03 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  60.73 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  61.72 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  60.73 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  59.54 
 
 		 394 aa  501  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  60.73 
 
 		 397 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 397 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  61.56 
 
 		 394 aa  494  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  60.53 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  61.08 
 
 		 406 aa  497  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  61.52 
 
 		 399 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  59.59 
 
 		 405 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  59.69 
 
 		 422 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0079  tryptophan synthase subunit beta  63.07 
 
 		 382 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  58.61 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  59.84 
 
 		 418 aa  497  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  61.72 
 
 		 397 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  61.46 
 
 		 389 aa  496  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  62.11 
 
 		 393 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  60 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  59.07 
 
 		 405 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  60.47 
 
 		 397 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  64.83 
 
 		 389 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 		 400 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1261  tryptophan synthase subunit beta  59.95 
 
 		 404 aa  493  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>