More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2049 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
308 aa  583  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.33 
 
 
304 aa  233  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.08 
 
 
312 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.76 
 
 
310 aa  208  7e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.2 
 
 
367 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1533  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43 
 
 
324 aa  195  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.04 
 
 
302 aa  190  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41 
 
 
315 aa  186  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.59 
 
 
331 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.41 
 
 
306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 
340 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3540  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.46 
 
 
313 aa  176  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.24 
 
 
317 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.41 
 
 
313 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  31.03 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  30.32 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.6 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  26.6 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  26.6 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  26.6 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  28.03 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  26.6 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  26.6 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  26.6 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  29.3 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  27.37 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.54 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  26.35 
 
 
414 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.75 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  26.26 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  25.52 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  25.52 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  25.52 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  25.52 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  29.85 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  25.52 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.81 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  24.66 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  28.62 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  29.17 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  33.95 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  29.01 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  25.52 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  29.01 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  28.67 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  26.89 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.95 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  23.26 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  30.1 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  25.91 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  24.58 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  24.24 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  28.89 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  27.85 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  23.18 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  26.8 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  26.86 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  27.33 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  27.33 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  23.34 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.22 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  25.42 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  28.52 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  23.53 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  28.83 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  25.83 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  29.58 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  27.67 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  27.67 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  30.71 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  30.82 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  28.71 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  25.09 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  30.49 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  30.28 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  28.39 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  23.67 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  23.16 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.723736  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  26.17 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  28.83 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  32.84 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  29.93 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.31 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  26.44 
 
 
296 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.4 
 
 
314 aa  67  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  23.92 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.26 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>