33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1798 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  100 
 
 		 387 aa  767    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  60.88 
 
 		 386 aa  484  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  57.25 
 
 		 392 aa  431  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  57.65 
 
 		 391 aa  427  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  55.87 
 
 		 391 aa  421  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  40.35 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  40.7 
 
 		 395 aa  256  7e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  37.41 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  36.87 
 
 		 374 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  36.5 
 
 		 380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  35.34 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  37.56 
 
 		 387 aa  219  7e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  32.76 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  36.09 
 
 		 388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  30.27 
 
 		 389 aa  169  6e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  30.89 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  35.68 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  32.75 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  33.91 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  35.06 
 
 		 312 aa  107  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.773478 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  33.5 
 
 		 330 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  35.45 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  22.99 
 
 		 373 aa  90.5  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  25.12 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  24.06 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  23.42 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48208  predicted protein  25.57 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.180067 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41816  predicted protein  25.57 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.251296 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  24.21 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  23.29 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  25.31 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03033  DNA primase subunit Pri1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09020)  25.1 
 
 		 521 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.344659 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  32.95 
 
 		 437 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>