More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0510 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
420 aa  855  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  50.23 
 
 
408 aa  407  1e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  37.27 
 
 
400 aa  264  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  38.52 
 
 
400 aa  256  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  36.72 
 
 
416 aa  222  1e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  31.57 
 
 
411 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  31.57 
 
 
411 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  32.39 
 
 
401 aa  203  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  32.39 
 
 
401 aa  203  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  30.75 
 
 
400 aa  190  3e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  32.44 
 
 
433 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  32 
 
 
410 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  31.16 
 
 
403 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  28.47 
 
 
402 aa  175  1e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  30.39 
 
 
412 aa  175  1e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  28.34 
 
 
402 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  28.41 
 
 
401 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  31.16 
 
 
396 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  32.03 
 
 
410 aa  170  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  30.4 
 
 
439 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  29.66 
 
 
406 aa  167  3e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  29.67 
 
 
403 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  29.23 
 
 
411 aa  166  7e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  30.56 
 
 
401 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  29.1 
 
 
403 aa  163  5e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  28.47 
 
 
411 aa  163  5e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  28.94 
 
 
400 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  28.37 
 
 
396 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  29.98 
 
 
413 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  28.97 
 
 
403 aa  160  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  28.51 
 
 
411 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  28.51 
 
 
411 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  28.94 
 
 
410 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  28.94 
 
 
410 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  28.94 
 
 
410 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  28.94 
 
 
410 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  28.94 
 
 
410 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  28.94 
 
 
410 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  28.94 
 
 
410 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  30.11 
 
 
404 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  28.47 
 
 
404 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  29.11 
 
 
400 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  27.94 
 
 
396 aa  156  5e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  27.79 
 
 
397 aa  156  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  26.82 
 
 
396 aa  156  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  27.91 
 
 
403 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  28.14 
 
 
403 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  28.37 
 
 
403 aa  154  3e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  29.98 
 
 
413 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  27.48 
 
 
403 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  28.17 
 
 
401 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  27.29 
 
 
397 aa  147  4e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  28.6 
 
 
405 aa  147  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.13698e-06 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  28.47 
 
 
407 aa  146  7e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  26.73 
 
 
413 aa  146  7e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  27.55 
 
 
406 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  27.78 
 
 
410 aa  143  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  24.36 
 
 
397 aa  141  2e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  28.01 
 
 
407 aa  141  2e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  28.37 
 
 
408 aa  136  7e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  38.25 
 
 
300 aa  131  2e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  31.25 
 
 
398 aa  128  2e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  30.41 
 
 
532 aa  126  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  34.74 
 
 
562 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  28.57 
 
 
417 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  26.76 
 
 
399 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  27.85 
 
 
410 aa  116  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  39.19 
 
 
328 aa  115  1e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  34.78 
 
 
297 aa  115  2e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  36.22 
 
 
311 aa  114  4e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  29.47 
 
 
326 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  34.59 
 
 
523 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 
297 aa  112  1e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
521 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  32.65 
 
 
302 aa  109  7e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  32.49 
 
 
317 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.79805e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  32.49 
 
 
317 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.01663e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  32.49 
 
 
317 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  32.49 
 
 
317 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  32.49 
 
 
317 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  36.07 
 
 
521 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  35.8 
 
 
305 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0612  flagellar hook-associated protein 3  25.92 
 
 
417 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.403095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  25.81 
 
 
420 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  31.72 
 
 
248 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  31.12 
 
 
304 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  31.72 
 
 
326 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  31.72 
 
 
326 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  33.88 
 
 
524 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 
530 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  25.46 
 
 
420 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  32.32 
 
 
317 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  31.82 
 
 
317 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  26.9 
 
 
428 aa  102  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  33.51 
 
 
301 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  32.18 
 
 
304 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  7.47775e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  31.82 
 
 
317 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  4.76574e-07 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  31.82 
 
 
317 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  31.82 
 
 
317 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  31.82 
 
 
317 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>