57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2506 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  69.95 
 
 
459 aa  643  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  67.76 
 
 
458 aa  644  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  71.1 
 
 
456 aa  639  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  100 
 
 
453 aa  935  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  50.58 
 
 
432 aa  460  1e-128  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  49.33 
 
 
432 aa  459  1e-128  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  47.72 
 
 
536 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  45.56 
 
 
538 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  44.86 
 
 
538 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  43.39 
 
 
480 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  44.73 
 
 
538 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  44.08 
 
 
478 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  42.56 
 
 
468 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16786e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  41.38 
 
 
469 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  40.68 
 
 
519 aa  348  8e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  43.06 
 
 
578 aa  345  9e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  38.69 
 
 
441 aa  337  2e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  38.34 
 
 
452 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  36.97 
 
 
434 aa  305  1e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  38.28 
 
 
466 aa  302  7e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  35.75 
 
 
435 aa  296  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  37.12 
 
 
466 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  35.9 
 
 
436 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  35.9 
 
 
436 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  35.38 
 
 
441 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  35.66 
 
 
435 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  37.59 
 
 
466 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  37.76 
 
 
466 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  37.76 
 
 
466 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  35.35 
 
 
472 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  38.05 
 
 
466 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  34.97 
 
 
436 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  38.17 
 
 
427 aa  285  1e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  34.9 
 
 
440 aa  285  1e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  37.21 
 
 
460 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  35.73 
 
 
460 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  36.08 
 
 
499 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  35.16 
 
 
470 aa  280  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  35.73 
 
 
460 aa  279  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  35.73 
 
 
460 aa  279  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  35.15 
 
 
438 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  31.16 
 
 
437 aa  219  9e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  30.1 
 
 
718 aa  52  2e-05  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  36.11 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  38.24 
 
 
775 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  24.2 
 
 
764 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.99 
 
 
738 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.82 
 
 
739 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  37.5 
 
 
713 aa  44.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.88 
 
 
810 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  36.07 
 
 
414 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.4 
 
 
781 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.71 
 
 
759 aa  43.5  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  31.25 
 
 
417 aa  43.5  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.58 
 
 
805 aa  43.5  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.4 
 
 
784 aa  43.5  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.4 
 
 
781 aa  43.5  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>