49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3240 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  68.74 
 
 		 453 aa  650    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 459 aa  936    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  78.29 
 
 		 456 aa  693    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  94.99 
 
 		 458 aa  897    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  49.55 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  50.23 
 
 		 432 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  44.42 
 
 		 536 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  45.45 
 
 		 538 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  45.22 
 
 		 538 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  44.99 
 
 		 538 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  43.16 
 
 		 480 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  42.19 
 
 		 469 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  44.68 
 
 		 468 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  45.03 
 
 		 478 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  42.14 
 
 		 519 aa  361  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  40 
 
 		 441 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  42.19 
 
 		 578 aa  342  7e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  39.08 
 
 		 441 aa  322  9.000000000000001e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  40.42 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  37.84 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  37.84 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  40.05 
 
 		 434 aa  316  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  37.41 
 
 		 436 aa  316  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  37.76 
 
 		 435 aa  315  8e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  37.64 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  37.92 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  38.17 
 
 		 499 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  37.27 
 
 		 466 aa  293  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  37.5 
 
 		 466 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  34.3 
 
 		 440 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  37.27 
 
 		 466 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  37.5 
 
 		 466 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  37.5 
 
 		 466 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  37.5 
 
 		 466 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  36.7 
 
 		 472 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  36.98 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  36.05 
 
 		 460 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  35.42 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  36.05 
 
 		 460 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  36.05 
 
 		 460 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  36.62 
 
 		 470 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  31.65 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  40.26 
 
 		 652 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06263  mitochondrial AAA ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12920)  31.52 
 
 		 956 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137043  normal  0.111453 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.15 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  46.15 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 		 443 aa  43.9  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  55 
 
 		 422 aa  43.5  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.66 
 
 		 804 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>