42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002642 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  100 
 
 		 437 aa  900    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  36.77 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  36.54 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  33.73 
 
 		 536 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  34.81 
 
 		 441 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  35.95 
 
 		 452 aa  262  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  34.45 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  34.54 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  33.02 
 
 		 468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  34.19 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  31.59 
 
 		 469 aa  233  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  33.17 
 
 		 434 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  33.02 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  33.25 
 
 		 499 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  33.49 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  33.25 
 
 		 427 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  31.51 
 
 		 538 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  30.8 
 
 		 538 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  31.12 
 
 		 578 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  32.43 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  31.44 
 
 		 538 aa  222  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  33.73 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  32.1 
 
 		 436 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  32.46 
 
 		 466 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  32.1 
 
 		 436 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  31.16 
 
 		 453 aa  219  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  33.17 
 
 		 466 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  31.21 
 
 		 458 aa  216  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  32.01 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  33.17 
 
 		 466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  32.78 
 
 		 466 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  32.78 
 
 		 466 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  31.26 
 
 		 460 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  31.65 
 
 		 459 aa  212  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  31.26 
 
 		 460 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  31.26 
 
 		 460 aa  212  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  30.97 
 
 		 460 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  30.93 
 
 		 435 aa  209  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  30.79 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  31.14 
 
 		 519 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  31.64 
 
 		 456 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  31.88 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>