50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1877 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  67.76 
 
 		 453 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  78.11 
 
 		 456 aa  696    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 458 aa  934    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  94.34 
 
 		 459 aa  884    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  50 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  50.93 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  44.98 
 
 		 536 aa  408  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  44.99 
 
 		 538 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  41.49 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  45.22 
 
 		 538 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  45.22 
 
 		 538 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  44.39 
 
 		 468 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  43.62 
 
 		 480 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  44.57 
 
 		 478 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  43.11 
 
 		 519 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  39.3 
 
 		 441 aa  339  7e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  41.59 
 
 		 578 aa  338  9e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  40.74 
 
 		 452 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  37.39 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  38.13 
 
 		 436 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  38.13 
 
 		 436 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  38.11 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  38.34 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  40.28 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  37.01 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  37.67 
 
 		 499 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  37.76 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  37.76 
 
 		 466 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  37.76 
 
 		 466 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  37.5 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  36.61 
 
 		 427 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  33.77 
 
 		 440 aa  289  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  38 
 
 		 466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  38 
 
 		 466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  38 
 
 		 466 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  36.01 
 
 		 460 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  34.93 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  36.62 
 
 		 470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  34.97 
 
 		 460 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  34.97 
 
 		 460 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  34.97 
 
 		 460 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  31.21 
 
 		 437 aa  216  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  40.26 
 
 		 652 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  47.92 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.11 
 
 		 727 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25 
 
 		 738 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06263  mitochondrial AAA ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12920)  31.52 
 
 		 956 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137043  normal  0.111453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  33.33 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  55 
 
 		 422 aa  43.5  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>