42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2355 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  79.13 
 
 		 436 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  77.98 
 
 		 436 aa  718    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  77.98 
 
 		 436 aa  718    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  897    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  69.55 
 
 		 441 aa  643    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  64.2 
 
 		 435 aa  600  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  38.42 
 
 		 480 aa  318  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  36.84 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  37.01 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  37.64 
 
 		 459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  38.1 
 
 		 468 aa  312  7.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  39.43 
 
 		 536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  38.21 
 
 		 434 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  37.88 
 
 		 452 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  36.83 
 
 		 456 aa  295  8e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  35.66 
 
 		 453 aa  293  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  37.94 
 
 		 478 aa  293  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  36.92 
 
 		 432 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  38.33 
 
 		 578 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  38.15 
 
 		 440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  36.59 
 
 		 519 aa  281  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  36.58 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  35.01 
 
 		 538 aa  276  7e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  35.56 
 
 		 441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  36.88 
 
 		 438 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  37.4 
 
 		 470 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  32.7 
 
 		 538 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  35.27 
 
 		 472 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  32.61 
 
 		 538 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  33.66 
 
 		 427 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  34.46 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  31.98 
 
 		 466 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  31.65 
 
 		 466 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  31.5 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  30.33 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  31.65 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  31.65 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  31.65 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  30.62 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  30.62 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  30.62 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  30.79 
 
 		 437 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>