42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2121 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  90.05 
 
 		 432 aa  808    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  100 
 
 		 432 aa  887    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  50.58 
 
 		 453 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  51.57 
 
 		 456 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  50.93 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  50.23 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  47.1 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  44.31 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  46.99 
 
 		 480 aa  395  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  46.63 
 
 		 536 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  47.13 
 
 		 538 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  45.43 
 
 		 538 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  44.5 
 
 		 538 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  43.16 
 
 		 478 aa  362  6e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  42.33 
 
 		 519 aa  347  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  43.1 
 
 		 578 aa  340  2.9999999999999998e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  41.49 
 
 		 441 aa  338  9e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  39.48 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  40.05 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  38.74 
 
 		 466 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  38.57 
 
 		 472 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  37.38 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  35.55 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  37.68 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  36.43 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  36.43 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  36.58 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  35.86 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  34.79 
 
 		 441 aa  277  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  36.43 
 
 		 436 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  37.53 
 
 		 466 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  36.51 
 
 		 499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  37.29 
 
 		 466 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  37.29 
 
 		 466 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  36.32 
 
 		 460 aa  265  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  34.3 
 
 		 460 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  34.3 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  34.3 
 
 		 460 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  35.86 
 
 		 470 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  36.95 
 
 		 427 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  34.83 
 
 		 438 aa  259  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  33.49 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>