43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0791 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  100 
 
 		 452 aa  920    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  49.53 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  46.79 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  47.22 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  46.88 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  46.88 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  46.42 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  47.26 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  46.88 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  46.9 
 
 		 466 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  46.05 
 
 		 466 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  47.73 
 
 		 466 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  47.73 
 
 		 466 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  47.73 
 
 		 466 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  45 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  40.95 
 
 		 478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  40.74 
 
 		 458 aa  325  8.000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  38.76 
 
 		 480 aa  323  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  38.58 
 
 		 469 aa  322  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  38.59 
 
 		 440 aa  322  7e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  40.42 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  38.34 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  37.5 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  38.07 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  38.69 
 
 		 456 aa  307  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  37.62 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  39.48 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  38.22 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  37.88 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  37.8 
 
 		 538 aa  299  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  39.51 
 
 		 427 aa  296  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  37.32 
 
 		 538 aa  293  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  36.4 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  36.6 
 
 		 538 aa  288  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  36.18 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  36.41 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  36.41 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  35.6 
 
 		 578 aa  281  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  36.3 
 
 		 519 aa  275  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  34.98 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  34.82 
 
 		 435 aa  266  4e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  35.95 
 
 		 437 aa  262  8.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.9 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>