More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1665 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1665  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.244402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2969  GntR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.233568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3903  GntR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000301963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2275  transcriptional regulator, GntR family  44.74 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1165  GntR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0118  transcriptional regulator, GntR family  42.24 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000889333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0445  GntR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0436  GntR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2910  regulatory protein GntR HTH  45.54 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2835  GntR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.062788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2807  gluconate operon transcriptional repressor  53.33 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00313262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3079  transcriptional regulator, GntR family  53.33 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2769  GntR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3062  transcriptional regulator, GntR family  53.33 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3049  GntR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1549  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.478849  decreased coverage  0.0000058181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2387  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.136165 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2507  transcriptional regulator, GntR family  56.58 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1108  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0952489  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1981  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2129  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.625758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2162  transcriptional regulator, GntR family  41.28 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4353  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000250168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4333  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000068149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1382  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00127899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4126  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000992152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3966  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000936551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4445  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4299  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4077  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000584944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4242  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3976  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  32.71 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  42.06 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  38.32 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  31.62 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  45.12 
 
 		 493 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1243  transcriptional regulator, GntR family  39.45 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.157686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0168  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0222  transcriptional regulator, GntR family  38.6 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.672326  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0191  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  50.77 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  50.77 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  30.25 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0548  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0732  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0138087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  40.87 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1480  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.897854 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1824  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0664  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2285  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2000  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0065  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1803  GntR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 498 aa  67  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3873  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2352  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2650  transcriptional regulator, putative  43.21 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.47 
 
 		 593 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0169  transcriptional regulator, GntR family  42.25 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1368  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1175  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0796897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0429  regulatory protein GntR HTH  44.21 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2461  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  32.74 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  37.08 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2729  transcriptional regulator, GntR family  46.27 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0268085 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0279  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 461 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  37.35 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  36.04 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 473 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  35.48 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6358  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  32.28 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 305 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 477 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  31.31 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 265 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  35.19 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 466 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>