245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1066 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  100 
 
 		 454 aa  896    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  62.89 
 
 		 458 aa  595  1e-169  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  62.97 
 
 		 458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  61.78 
 
 		 457 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  63.03 
 
 		 454 aa  560  1e-158  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  61.92 
 
 		 454 aa  555  1e-157  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  60.91 
 
 		 447 aa  526  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  60.91 
 
 		 447 aa  526  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  60.23 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  40.8 
 
 		 453 aa  345  8e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.95 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  36.59 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  36.14 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  36.14 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  36.14 
 
 		 446 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  36.14 
 
 		 446 aa  299  7e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  35.63 
 
 		 446 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  35.92 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  35.7 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  36.34 
 
 		 446 aa  296  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  36.14 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  35.92 
 
 		 446 aa  295  9e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  36.67 
 
 		 452 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  37.14 
 
 		 450 aa  292  7e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.76 
 
 		 476 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  37.78 
 
 		 450 aa  290  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  35.21 
 
 		 470 aa  286  8e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  39.43 
 
 		 475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35.1 
 
 		 452 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  35.08 
 
 		 464 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 		 452 aa  277  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  37.31 
 
 		 456 aa  276  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  35.37 
 
 		 452 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  33.04 
 
 		 446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  36.91 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  36.91 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  33.04 
 
 		 464 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  34.73 
 
 		 486 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  33.55 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  34.14 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  35.47 
 
 		 456 aa  269  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  32.68 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  36.73 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  33.77 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  34.48 
 
 		 465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  36.12 
 
 		 443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  38.39 
 
 		 445 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  38.39 
 
 		 445 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  37.81 
 
 		 445 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  38.39 
 
 		 445 aa  266  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  37.81 
 
 		 445 aa  266  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  37.81 
 
 		 445 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  34.44 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  37.58 
 
 		 445 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  34.28 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  37.36 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  34.74 
 
 		 454 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  38.31 
 
 		 447 aa  263  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  34.52 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  38.31 
 
 		 451 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  32.43 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  38.31 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  31.42 
 
 		 486 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  38.31 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  38.08 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  37.86 
 
 		 452 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  37.75 
 
 		 445 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  38.05 
 
 		 447 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  37.42 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  37.42 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  33.62 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  33.48 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  32.53 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  31.89 
 
 		 459 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  35.49 
 
 		 450 aa  251  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  33.19 
 
 		 461 aa  250  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  34.26 
 
 		 455 aa  250  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  37.42 
 
 		 452 aa  249  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  34.98 
 
 		 447 aa  247  3e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2187  sodium-dependent transporter, SNF family  34.21 
 
 		 450 aa  247  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0307557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  30.02 
 
 		 457 aa  247  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  38.31 
 
 		 452 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4776  sodium:neurotransmitter symporter  31.29 
 
 		 459 aa  247  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0479599 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  37.42 
 
 		 452 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  32.89 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2213  sodium:neurotransmitter symporter family protein  33.99 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  35.71 
 
 		 451 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  31.17 
 
 		 451 aa  243  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  34.55 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2107  sodium:neurotransmitter symporter  34.64 
 
 		 461 aa  236  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0608619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  36.6 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  31.76 
 
 		 470 aa  233  6e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  33.89 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  31.37 
 
 		 483 aa  230  4e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06620  SNF family Na+-dependent transporter  29.25 
 
 		 469 aa  229  7e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.529082  normal  0.37992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  32.24 
 
 		 460 aa  229  8e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  34.75 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  33.93 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  30.34 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1013  sodium transporter, putative  34.75 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>