More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0643 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0643  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  100 
 
 		 346 aa  718    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0435  extracellular solute-binding protein, family 1  71.68 
 
 		 343 aa  523  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0833  extracellular solute-binding protein  71.3 
 
 		 343 aa  519  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0625  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  73.27 
 
 		 344 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1366  extracellular solute-binding protein family 1  68.44 
 
 		 344 aa  500  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1772  extracellular solute-binding protein family 1  67.55 
 
 		 344 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.320595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2485  extracellular solute-binding protein family 1  71.38 
 
 		 343 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.390798  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0641  Fe3+ ABC transporter, iron-binding protein  61.27 
 
 		 343 aa  461  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.147653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1761  extracellular solute-binding protein family 1  48.35 
 
 		 341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.0475771 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3752  extracellular solute-binding protein  49.84 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.236177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6061  extracellular solute-binding protein family 1  47.69 
 
 		 342 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4317  extracellular solute-binding protein  49.21 
 
 		 343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.362014 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0720  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.73 
 
 		 341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.631762  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0676  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  48.42 
 
 		 341 aa  301  9e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1097  extracellular solute-binding protein family 1  47.43 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3115  extracellular solute-binding protein  45.48 
 
 		 342 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0701659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1991  extracellular solute-binding protein family 1  43.21 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000248153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3281  extracellular solute-binding protein  42.14 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1363  extracellular solute-binding protein  43.64 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.634696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4977  extracellular solute-binding protein family 1  43.16 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187207  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6060  extracellular solute-binding protein family 1  42.68 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1762  extracellular solute-binding protein family 1  40.54 
 
 		 340 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.66245  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0283  extracellular solute-binding protein family 1  43.15 
 
 		 342 aa  239  5e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2993  extracellular solute-binding protein family 1  39.43 
 
 		 350 aa  235  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0009  extracellular solute-binding protein family 1  37.75 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.892782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1638  iron ABC transporter substrate-binding protein  37.68 
 
 		 266 aa  186  6e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4649  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4877  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  0.38801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2479  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.05 
 
 		 347 aa  166  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1237  extracellular metal-binding protein  32.81 
 
 		 358 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3970  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.75 
 
 		 358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1235  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  33.44 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1212  iron ABC transporter solute-binding protein  33.44 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1214  iron ABC transporter solute-binding protein  33.44 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1337  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  33.44 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1411  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.44 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1436  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  33.44 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4607  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  32.34 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.980284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4473  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  32.34 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.144148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1476  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.12 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1374  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.44 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4694  extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1282  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  29.73 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5874  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 341 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0545  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.45 
 
 		 339 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.001131  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1048  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5525  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655164  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000273849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1545  extracellular solute-binding protein family 1  31.42 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.061269  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04090  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  30.82 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.510256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2917  extracellular solute-binding protein family 1  31.12 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0811  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.38 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000766  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  33.68 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5367  extracellular solute-binding protein  33.84 
 
 		 341 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2899  extracellular solute-binding protein  30.03 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00994055 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04877  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  33.68 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1107  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.695758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  32.7 
 
 		 341 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491174  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5135  ABC transporter, periplasmic binding protein  31.07 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.659918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5008  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0330  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  32.7 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.631264 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0333  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.853179  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1570  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.840173  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3135  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  33.21 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6494  ABC Fe3+ siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  32.58 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000128013  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3159  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, 1-aminoethylphosphonate-binding protein component  31.95 
 
 		 351 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.451295  normal  0.0280644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5376  putative lipoprotein  34.34 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5430  putative lipoprotein  34.34 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3791  ABC transporter, substrate-binding protein  31.03 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2746  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  31.3 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.553799  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5110  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4941  ABC transporter substrate-binding protein  31.53 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4956  ABC transporter substrate-binding protein  33.58 
 
 		 344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5350  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5501  putative lipoprotein  31.53 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5572  putative lipoprotein  31.85 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5382  putative lipoprotein  31.85 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5052  putative lipoprotein  31.83 
 
 		 344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2476  ABC-type iron(III)-binding periplasmic protein precursor  28.77 
 
 		 364 aa  125  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000339151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5871  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1586  extracellular solute-binding protein family 1  29.15 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.74 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  27.42 
 
 		 339 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1588  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 368 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1418  extracellular solute-binding protein family 1  29.33 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58033  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1485  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 		 470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0472403  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2025  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.727103  hitchhiker  0.0000000026678 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4046  putative periplasmic solute-binding protein  30.34 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0699034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  30.63 
 
 		 370 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2031  ABC-type transporter, periplasmic component  25.93 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.702659  hitchhiker  0.000664756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  28.86 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2074  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1117  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 361 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1116  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.92 
 
 		 353 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>