111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1232 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  100 
 
 		 333 aa  669    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  42.51 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  44.68 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  43.59 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  32.35 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  30.39 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  38.55 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2783  Abortive infection protein  34.29 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19991  normal  0.142133 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0017  CAAX amino terminal protease family protein  28.76 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000644496  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  34.86 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  35.71 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0172  protease, putative  40.24 
 
 		 221 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  30.47 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  28.04 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  34.51 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  35.51 
 
 		 292 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  29.3 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  35.45 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  28.32 
 
 		 227 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  42.39 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 337 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  31.45 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 337 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  33.93 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  36.9 
 
 		 337 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0797  abortive infection protein  30.16 
 
 		 521 aa  52.8  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.115153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  33.93 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  37.35 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  35.56 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  33.33 
 
 		 220 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2068  hypothetical protein  31.4 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000680357  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2105  hypothetical protein  31.4 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00255983  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  41.46 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  34.44 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  26.05 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  41.03 
 
 		 221 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  26.64 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  27.22 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  27.22 
 
 		 235 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  37.35 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  26.64 
 
 		 249 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  36.14 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  26.64 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2540  abortive infection protein  31.82 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.456595  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  27.22 
 
 		 253 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  25 
 
 		 362 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  33.12 
 
 		 284 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  33.63 
 
 		 244 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26607  predicted protein  37.78 
 
 		 343 aa  49.3  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05181  membrane-associated protease  30.17 
 
 		 453 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  36.9 
 
 		 176 aa  49.3  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1486  abortive infection family protein  34.04 
 
 		 246 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000034413  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1656  membrane associated protease  34.62 
 
 		 420 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  26.81 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  29.06 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  36.47 
 
 		 538 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  40.74 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  26.17 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  30.82 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  36.59 
 
 		 528 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  39.76 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1092  abortive infection protein  37.5 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  35.87 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  40.74 
 
 		 282 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0019  Abortive infection protein  32.67 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718936  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  40.74 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  40.74 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  40.74 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  23.68 
 
 		 308 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  31.73 
 
 		 225 aa  47  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  29.52 
 
 		 225 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  40.74 
 
 		 282 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0005  Abortive infection protein  35.23 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_002950  PG0518  hypothetical protein  26.67 
 
 		 241 aa  46.2  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0659  abortive infection protein  38.38 
 
 		 328 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0273  Abortive infection protein  31.15 
 
 		 166 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2005  abortive infection protein  30.19 
 
 		 262 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0944847  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0702  membrane associated protease  32.05 
 
 		 420 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  32.84 
 
 		 515 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  31.73 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  29.75 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3003  abortive infection protein  30.85 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.167369  normal  0.743938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  36.05 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2661  abortive infection protein  35.16 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.612389 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  25.24 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  35.37 
 
 		 527 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2888  Abortive infection protein  35.16 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.978544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  26.42 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  35.37 
 
 		 527 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1134  hypothetical protein  23.78 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  36.71 
 
 		 234 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  32.22 
 
 		 602 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  32.47 
 
 		 227 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0151  Abortive infection protein  32.35 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  39.78 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1896  abortive infection family protein  35.87 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  30.68 
 
 		 237 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  36.17 
 
 		 253 aa  43.5  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>