91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1203 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 87 aa  181  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0168328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2804  ferredoxin family protein  87.36 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0672  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  86.21 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.534446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2139  ferredoxin III, nif-specific  82.56 
 
 		 87 aa  153  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480151 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2079  ferredoxin III, nif-specific  82.56 
 
 		 87 aa  153  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3489  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  70.59 
 
 		 87 aa  134  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  67.82 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3025  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  63.95 
 
 		 87 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  62.79 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  55.29 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0633  ferredoxin III, nif-specific  53.93 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2104  ferredoxin III, nif-specific  40.62 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000996016 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1230  ferredoxin III, nif-specific  37.5 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000308557 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1253  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 101 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.908705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0534  putative dimeric ferredoxin (FdIII)  42.27 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.165776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2186  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.27 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1510  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.68 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1512  ferredoxin  36.46 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.560047  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4805  ferredoxin III, nif-specific  39.18 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.866548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1885  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.11 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4259  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.79 
 
 		 98 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0445  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.16262 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1191  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.21 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000682014 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1802  ferredoxin III, nif-specific  37.89 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1830  ferredoxin III, nif-specific  37.89 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7733  ferredoxin III, nif-specific  40.96 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2643  ferredoxin III  36.96 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.405945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0238  ferredoxin, 4Fe-4S  35.63 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.194696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2282  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.95 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  38.36 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1475  hypothetical protein  39.08 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0481  ferredoxin III, nif-specific  39.76 
 
 		 103 aa  67  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.92658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2320  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0977  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.21 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3624  ferredoxin III, nif-specific  36.36 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182851 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4902  ferredoxin III, nif-specific  40 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6219  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  36.78 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0096  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  37.35 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.418618  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3542  ferredoxin III, nif-specific  33.66 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.923414  hitchhiker  0.00998746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1354  ferredoxin III, nif-specific  32.63 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1081  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.63 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  34.65 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.63 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5917  ferredoxin-3 (ferredoxin III) (FdIII)  30 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5093  ferredoxin III, nif-specific  34.88 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1562  ferredoxin III, nif-specific  35.29 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.08 
 
 		 652 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.21 
 
 		 432 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.35 
 
 		 426 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.8 
 
 		 432 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.94 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.18 
 
 		 377 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0468  signal-transduction protein  32.79 
 
 		 326 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.125396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  32.39 
 
 		 318 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2823  electron transport complex, B subunit  31.65 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1608  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.74 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.55229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1300  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.5 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  36.67 
 
 		 500 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3563  aldo/keto reductase  35.09 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709753  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.35 
 
 		 432 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50970  Electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  26.19 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0817561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  34.43 
 
 		 501 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01510  nitrogen fixation (4Fe-4S) ferredoxin-like protein  37.78 
 
 		 51 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41732  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.94 
 
 		 435 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.86 
 
 		 427 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0879  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.73 
 
 		 381 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0720  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.25 
 
 		 681 aa  42  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340491  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0685  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.12 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1080  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  25.26 
 
 		 1190 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0440  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.53 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01588  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1474  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.23 
 
 		 425 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2013  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144398  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1817  electron transport complex protein RnfB  30 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0338518  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1571  electron transport complex protein RnfB  30 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2001  electron transport complex protein RnfB  30 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000498524  normal  0.338717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01598  electron transport complex protein RnfB  30 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000941545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1836  electron transport complex protein RnfB  30 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.912519  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1704  electron transport complex protein RnfB  30 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2340  electron transport complex protein RnfB  30 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.297329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 950 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1935  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.85 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1546  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 		 377 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  28.57 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0919  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 281 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3443  dihydropyrimidine dehydrogenase  33.87 
 
 		 424 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_002950  PG1813  ferredoxin, 4Fe-4S  28.36 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 367 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  32.86 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0618  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 		 1186 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>