193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0597 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0597  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 512 aa  1059    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0908  hypothetical protein  49.59 
 
 		 503 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.207571  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1647  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.1 
 
 		 502 aa  518  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.887162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1736  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.1 
 
 		 502 aa  520  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00739697  normal  0.272754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0910  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.49 
 
 		 564 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1534  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.23 
 
 		 537 aa  340  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0431591 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6486  filamentation induced by cAMP protein Fic  37 
 
 		 514 aa  336  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.761112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1039  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.36 
 
 		 516 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0890  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.08 
 
 		 555 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0367824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2096  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.71 
 
 		 479 aa  292  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0353  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.33 
 
 		 495 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2182  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.66 
 
 		 513 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108003  normal  0.0333314 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6074  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.24 
 
 		 544 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2191  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.77 
 
 		 508 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0424  hypothetical protein  31.37 
 
 		 512 aa  246  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00863334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1561  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.1 
 
 		 536 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2666  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.78 
 
 		 496 aa  243  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.939916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7027  putative filamentation induced by cAMP protein Fic  29.51 
 
 		 537 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1899  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.8 
 
 		 511 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.669104  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4531  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.29 
 
 		 514 aa  239  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49750  filamentation induced by cAMP protein  31.33 
 
 		 509 aa  237  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2478  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.52 
 
 		 526 aa  233  5e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.321663  normal  0.723541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0051  hypothetical protein  29.76 
 
 		 519 aa  230  4e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.53 
 
 		 498 aa  226  9e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2025  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.56 
 
 		 507 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.509627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2022  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.52 
 
 		 505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22590  hypothetical protein  33.74 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3761  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.36 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.651271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0601  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.39 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0607  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.39 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2194  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.21 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0593  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.65 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.74 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3955  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.02 
 
 		 384 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  34.29 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0154  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.21 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0242065 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.44 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0010  hypothetical protein  32.43 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05510  hypothetical protein  34.78 
 
 		 394 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.31 
 
 		 336 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1499  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.91 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  26.9 
 
 		 328 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.53 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.1 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22980  hypothetical protein  28.48 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.09 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4488  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.4 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.08 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3251  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.57 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0798212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.19 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  32.48 
 
 		 328 aa  57  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.02 
 
 		 387 aa  57  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33230  hypothetical protein  26.53 
 
 		 408 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4188  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.69 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4178  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.97 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.130851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  34 
 
 		 368 aa  55.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.8 
 
 		 377 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5504  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.19 
 
 		 394 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0732622  normal  0.099278 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.46 
 
 		 374 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  28.89 
 
 		 348 aa  54.7  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  28.89 
 
 		 348 aa  54.7  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.52 
 
 		 334 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  40 
 
 		 309 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.97 
 
 		 358 aa  53.5  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.57 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1106  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.67 
 
 		 533 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  32.17 
 
 		 376 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0617  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.02 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.86 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3972  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.99 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.21 
 
 		 347 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3978  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.51 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  34.78 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.04 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.36 
 
 		 373 aa  52  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  33.98 
 
 		 358 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.98 
 
 		 387 aa  51.6  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  31.63 
 
 		 365 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4175  filamentation induced by cAMP protein Fic  43.75 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.41 
 
 		 370 aa  51.6  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  27.41 
 
 		 359 aa  50.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  31.58 
 
 		 376 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2833  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.76 
 
 		 512 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.23 
 
 		 389 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0182  Fic family protein  34.69 
 
 		 352 aa  50.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  31.25 
 
 		 384 aa  50.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0471  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.15 
 
 		 393 aa  50.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.586751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2238  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.4 
 
 		 485 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76756  decreased coverage  0.000875847 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.54 
 
 		 376 aa  50.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  40.54 
 
 		 389 aa  50.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3926  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.38 
 
 		 500 aa  50.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118695  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2288  hypothetical protein  34.57 
 
 		 502 aa  50.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  40.54 
 
 		 376 aa  50.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.02 
 
 		 386 aa  50.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3058  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.96 
 
 		 541 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  37.33 
 
 		 367 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0828  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.65 
 
 		 509 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.32 
 
 		 367 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.03 
 
 		 372 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.73 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>