More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2412 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  100 
 
 
395 aa  782    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  62.56 
 
 
419 aa  488  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  49.74 
 
 
399 aa  339  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  49.87 
 
 
406 aa  335  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  45.41 
 
 
390 aa  318  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  44.24 
 
 
388 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  44.41 
 
 
395 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  37.14 
 
 
408 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  39.11 
 
 
380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  37.73 
 
 
411 aa  265  8e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  36.18 
 
 
411 aa  256  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  36.18 
 
 
411 aa  256  7e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4845  cytochrome P450  42.59 
 
 
405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  38.78 
 
 
404 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  38.78 
 
 
404 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  38.78 
 
 
404 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  39.84 
 
 
404 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2508  cytochrome P450  40.33 
 
 
404 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0157804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  39.78 
 
 
404 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  36.09 
 
 
403 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  39.4 
 
 
404 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2377  cytochrome P450 family protein  39.47 
 
 
404 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  42.55 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2668  cytochrome P450 family protein  39.72 
 
 
404 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0061482 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  34.46 
 
 
411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0603  cytochrome P450  40.75 
 
 
397 aa  239  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  44.15 
 
 
412 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  36.41 
 
 
387 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  38.46 
 
 
402 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.42 
 
 
420 aa  225  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  44.09 
 
 
399 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  40.17 
 
 
398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  36.09 
 
 
410 aa  222  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  39.14 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.39 
 
 
405 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  35.33 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  36.22 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  36.22 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  35.33 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.04 
 
 
412 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  43.71 
 
 
411 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  35.04 
 
 
411 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  35.04 
 
 
411 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  35.61 
 
 
411 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  40.48 
 
 
395 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  35.04 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  35.61 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  38.87 
 
 
398 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  39.08 
 
 
401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  36.83 
 
 
405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  39.76 
 
 
407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  39.66 
 
 
395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  45.58 
 
 
412 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2799  cytochrome P450  38.74 
 
 
409 aa  212  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  36.59 
 
 
411 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  39.14 
 
 
405 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  38.02 
 
 
402 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.8 
 
 
400 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  36.59 
 
 
411 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  35.51 
 
 
402 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  40.76 
 
 
414 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.32 
 
 
426 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  42.6 
 
 
416 aa  206  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  42.2 
 
 
423 aa  206  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  38.86 
 
 
400 aa  206  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  39.21 
 
 
417 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2772  cytochrome P450  36.68 
 
 
427 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.434969  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2742  cytochrome P450  36.68 
 
 
427 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0172964  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  40.72 
 
 
407 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2786  cytochrome P450  36.68 
 
 
427 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  40.72 
 
 
407 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  38.87 
 
 
398 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  36.01 
 
 
427 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  34.47 
 
 
402 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  40.72 
 
 
407 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  38.44 
 
 
419 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  35.49 
 
 
395 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  39.63 
 
 
408 aa  202  9e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  38.33 
 
 
394 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  36.89 
 
 
403 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  37.63 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3974  cytochrome P450  38.42 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0514816  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  36.15 
 
 
413 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  39.15 
 
 
409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.19 
 
 
411 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  38.48 
 
 
406 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12293  cytochrome P450 124 cyp124  40.32 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  38.96 
 
 
429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  33.93 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  37.16 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  37.16 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  37 
 
 
418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  38.18 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  35.7 
 
 
418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  36 
 
 
405 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  39.75 
 
 
407 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  39.38 
 
 
419 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  40.46 
 
 
408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  35.75 
 
 
402 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3307  cytochrome P450  38.22 
 
 
434 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>