228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3206 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 		 161 aa  314  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  81.99 
 
 		 161 aa  270  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  83.12 
 
 		 161 aa  269  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  80.75 
 
 		 161 aa  266  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  81.25 
 
 		 161 aa  264  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  80.12 
 
 		 161 aa  264  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  81.88 
 
 		 161 aa  264  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  64.38 
 
 		 161 aa  214  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  60.25 
 
 		 161 aa  192  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  59.75 
 
 		 163 aa  191  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  58.49 
 
 		 166 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  57.59 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  57.59 
 
 		 164 aa  183  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  55.7 
 
 		 163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  55.7 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  53.16 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  54.43 
 
 		 163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  54.43 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  54.43 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  54.43 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  54.43 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  54.43 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  54.43 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  54.43 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  55.7 
 
 		 163 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  54.43 
 
 		 163 aa  177  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  50.31 
 
 		 161 aa  176  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  50.31 
 
 		 161 aa  176  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  54.43 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  52.47 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 		 163 aa  167  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  51.25 
 
 		 164 aa  160  6e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  53.75 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  51.53 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  51.88 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  53.42 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  46.01 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  49.07 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  45.68 
 
 		 163 aa  150  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  49.69 
 
 		 159 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  50.31 
 
 		 163 aa  150  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  46.91 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  50.31 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  48.45 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03091  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 		 172 aa  147  9e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  47.83 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2278  putative nucleotide-binding protein  51.23 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57130  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4966  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  48.47 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  49.38 
 
 		 164 aa  144  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  48.15 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  48.45 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  48.75 
 
 		 165 aa  144  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  46.25 
 
 		 165 aa  143  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 		 163 aa  142  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  47.47 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  46.58 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3487  putative nucleotide-binding protein  47.2 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660179  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  49.37 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0112  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609186  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  47.56 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  47.85 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  47.5 
 
 		 165 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0318  protein of unknown function DUF520  47.83 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  47.5 
 
 		 165 aa  141  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  46.63 
 
 		 163 aa  141  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0533  putative nucleotide-binding protein  45.34 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2524  putative nucleotide-binding protein  47.24 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983821  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2177  putative nucleotide-binding protein  45.96 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1126  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  46.63 
 
 		 163 aa  140  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 		 163 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 		 163 aa  140  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  44.79 
 
 		 163 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0290  hypothetical protein  47.2 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 		 163 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 		 163 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 		 163 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 		 163 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>