228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2278 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2278  putative nucleotide-binding protein  100 
 
 
162 aa  321  3e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1634  putative nucleotide-binding protein  59.26 
 
 
163 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0454282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6212  protein of unknown function DUF520  53.7 
 
 
163 aa  192  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2479  putative nucleotide-binding protein  51.85 
 
 
163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0562563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  51.23 
 
 
161 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1191  putative nucleotide-binding protein  50.62 
 
 
163 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.566237  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2291  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
163 aa  154  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000470515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  50 
 
 
161 aa  154  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0033  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
161 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
163 aa  150  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  48.77 
 
 
161 aa  147  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
161 aa  144  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  46.3 
 
 
161 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  47.53 
 
 
161 aa  141  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1670  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
161 aa  136  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.502764  normal  0.473324 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1126  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1099  hypothetical protein  40.74 
 
 
163 aa  134  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2888  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  41.36 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  41.36 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  41.98 
 
 
163 aa  130  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1318  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
163 aa  130  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1036  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 
163 aa  130  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.448426  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3079  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421568  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0136  hypothetical protein  41.88 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3275  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 
163 aa  127  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  46.3 
 
 
162 aa  127  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  42.24 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  41.61 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0537  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.323651  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00374  nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3183  protein of unknown function DUF520  40.74 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.387868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3207  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000536011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0498  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0462  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0348  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
163 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0510  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.781965  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00378  hypothetical protein  40.74 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0458  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
163 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0094  putative nucleotide-binding protein  39.51 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  42.5 
 
 
163 aa  124  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  45.68 
 
 
164 aa  124  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0893  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
163 aa  124  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0474  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 
163 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0482  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 
163 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.101201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0476  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 
163 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0095  putative nucleotide-binding protein  37.65 
 
 
162 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.615818  normal  0.24721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  45.06 
 
 
163 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0495  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 
163 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0477  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
164 aa  123  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0409  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
164 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.67309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4087  putative nucleotide-binding protein  42.59 
 
 
159 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.568883  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3104  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
163 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  43.21 
 
 
163 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3067  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
163 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3247  putative nucleotide-binding protein  38.27 
 
 
163 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  122  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1084  putative nucleotide-binding protein  38.89 
 
 
163 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.235952  hitchhiker  0.00000304548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  44.44 
 
 
163 aa  122  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0959  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
161 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0688  putative nucleotide-binding protein  38.89 
 
 
163 aa  121  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.067831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  41.88 
 
 
163 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  41.88 
 
 
164 aa  121  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  41.25 
 
 
163 aa  121  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
164 aa  121  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2804  protein of unknown function DUF520  40.37 
 
 
165 aa  120  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000772661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4421  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 
161 aa  120  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425503  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
163 aa  120  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0939  putative nucleotide-binding protein  41.36 
 
 
159 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911761  normal  0.507719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
162 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  44.72 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0818  putative nucleotide-binding protein  37.65 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1352  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154119  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4393  hypothetical protein  40.74 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02358  putative nucleotide-binding protein  38.89 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  44.1 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4372  putative nucleotide-binding protein  41.98 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0514431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2033  hypothetical protein  40.85 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  45.06 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13410  putative nucleotide-binding protein  40.74 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1006  protein of unknown function DUF520  44.44 
 
 
163 aa  118  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  41.36 
 
 
164 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4534  protein of unknown function DUF520  42.59 
 
 
163 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.452055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
165 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0101  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 
162 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0782  putative nucleotide-binding protein  37.65 
 
 
161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  38.89 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>